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基因组装配中存在重复序列叠加时重叠群计数的推广的Lander-Waterman定理
  • ISSN号：1008-1542
  • 期刊名称：河北科技大学学报
  • 时间：2012
  • 页码：384-386
  • 分类：O29[理学—应用数学;理学—数学]
  • 作者机构：[1]河北科技大学图书馆,河北石家庄050018, [2]河北科技大学理学院,河北石家庄050018
  • 相关基金：国家自然科学基金资助项目（11171088）;河北省自然科学基金资助项目（A2011208002）
  • 相关项目：基于转录组的非编码RNA分类和预测算法的研究
作者： 黄海云|张屹|
关键词： Lander-Waterman公式, 重复序列, 基因组组装, 重叠群, Lander-Waterman formula, repeat sequence, genome assembly, contig
中文摘要：

针对基因组组装算法理论进行了改进，该研究对于经典的Lander—Waterman定理在repeatcollapse存在的情况下进行了推广，对于判断基因组组装的contig的个数是否合理，组装质量是否可靠有重要的参考价值。

英文摘要：

We improved the theory of algorithm of genome assembly which is a generalized Lander-waterman theorem under repeat collapse. It is important for appraising the rationality of the number of contig and the quality of genome assembly.

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期刊论文 31 会议论文 1
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期刊信息
  • 《河北科技大学学报》
  • 北大核心期刊（2008版）
  • 主管单位:河北省教育厅
  • 主办单位:河北科技大学
  • 主编：孙鹤旭
  • 地址：河北省石家庄市裕华东路70号
  • 邮编：050018
  • 邮箱：xuebao@hebust.edu.cn
  • 电话：0311-81668290
  • 国际标准刊号：ISSN：1008-1542
  • 国内统一刊号：ISSN：13-1225/TS
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊、RCCSE中国核心学术期刊（扩展...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘（网络版）,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2008版）
  • 被引量:4367