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大白菜温度敏感雄性不育育性转化相关XET基因的电子克隆
  • ISSN号:1000-6346
  • 期刊名称:《中国蔬菜》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100, [2]甘肃省农业科学院蔬菜研究所,甘肃兰州730070
  • 相关基金:国家自然科学基金(30871717); 国家科技支撑计划(2009BADB8B03)
中文摘要:

以从大白菜温敏雄性育性转化相关基因差异表达的分析中获得的EST-58为标签,采用电子克隆的方法对其进行延伸,并对电子克隆的结果进行RT-PCR验证,结果表明:电子克隆到1个由1197bp核苷酸组成的序列,该序列具有完整的开放阅读框架(ORF),编码蛋白为292个氨基酸。经RT-PCR扩增,连续样品间EST-58表达的带型变化趋势与cDNA-AFLP的差异显示情况一致,且RT-PCR获得的序列与电子克隆的序列一致性达98%。用该序列在GenBank数据库中进行blastX同源性分析,确定该序列为大白菜的XET基因(GenBank登陆号为EU579461)。

英文摘要:

The EST-58 related to the fertility changeover in the thermo-sensitive CMS (TsCMS7311) of Chinese cabbage (Brassica campestris L.ssp.pekinensis) was amplified by in silico cloning.And the cDNA sequence had been confirmed by RT-PCR.The result indicated that a new sequence with 1197 bp length was cloned,which contained an integrated ORF,encoding 292 amino acids.The trend of EST-58 expression by RT-PCR was very identity to the expression by cDNA-AFLP,and their sequences have 98% consistency.As showed that the result of in silico cloning was right.The amino acid sequence showed highly comparability with xyloglucan endotransglycosylase (XET) from GenBank.It indicated that the new sequence was XET gene (GenBank accession,EU579461) of Chinese cabbage.

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期刊信息
  • 《中国蔬菜》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院蔬菜花卉研究所
  • 主编:祝旅
  • 地址:北京中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgsc@caas.cn
  • 电话:010-68919550
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6346
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2326/S
  • 邮发代号:82-131
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖,第三届全国优秀农业期刊一等奖,中国期刊方阵双百期刊,第二届全国优秀科技期刊二等奖,全国农口学会优秀科技期刊奖,第一届全国优秀科技期刊二等奖,农业部优秀科技期刊奖,北京市全优期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19201