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正交设计优化金发藓科植物ISSR-PCR反应体系
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q781[生物学—分子生物学] Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]齐齐哈尔大学生命科学与工程学院生物系,黑龙江齐齐哈尔161006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目资助(N0.30470144)
中文摘要:

目的:建立金发藓科植物ISSR-PCR反应的最佳体系。方法:利用正交设计的方法,对金发藓科植物(Polytrichaceae)IS-SR-PCR反应的5因素(Mg2+,dNTP,primer,DNA template,Taq DNA polymerase)4水平进行试验。结果:在20μl反应体系中,模板DNA50ng,1.6μmol/L的引物,1×反应缓冲液,3.2mmol/L的Mg2+,dNTP为1.2mmol/L,2U的TaqDNA聚合酶,反应程序为94℃预变性6min;94℃变性45s,57℃退火45s,72℃延伸2min,循环40次;72℃延伸10min。利用此结论,对20种金发藓科植物进行ISSR-PCR扩增,扩增产物的多态性为69.52%。利用引物841构建的指纹图谱,可区分20种金发藓科植物中的18种,分辨率达90%。金发藓科植物ISSR-PCR反应体系的建立,为今后利用ISSR标记技术开展金发藓科植物种间遗传多样性分析提供一个标准化程序。

英文摘要:

Objective: The orthogonal design was used to optimize ISSR- PCR amplification system of Polytrichaceae in five factors (Mg^2+ , dNTP, primer, DNA template, Taq DNA polymerase) at four levels respectively. A suitable ISSR reaction system was established , namely 20μl reaction system containing 50ng DNA template, 1.6μmoL/L primer, 1 × PCR buffer, 3.2mmol/L Mg^2+ , 1.2mmol/L dNTP, 2U Taq DNA polymerase. The program of heating:pre- denaturation 6min at 94℃, then undergo a proceeding of reaction cycles as denaturation 45s at 94℃, anneal 45s at 57℃ ,extension 2min at 72℃ ,40 cycles,finally extension 10 min at 72℃. ISSR polymorphism among twenty Polytrichaceae was 69.52% ,and 18 out of 20 Polytriehaceae could be identified by 1SSR fingerprinter established with primer 841 .The result provided a standardizing program for the analysis of interspecies genetic diversity of Polytfichaceae.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
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  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503