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雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:遗传
  • 时间:2014.7
  • 页码:921-933
  • 分类:Q959.842[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]浙江农林大学、亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,临安311300, [2]浙江农林大学农业与食品科学学院、浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室,临安311300, [3]中国农业科学院棉花研究所、棉花生物学国家重点实验室,安阳455000
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划项目(863计划)(编号:2011AA100202),国家自然科学基金项目(编号:31200909),浙江省自然科学基金项目(编号:LQ12C06002)和棉花生物学国家重点实验室开放课题(编号:CB2013A02,CB2014B04)资助
  • 相关项目:棉花李氏突变体(Li1)重要候选基因GhAS1的克隆与功能解析
中文摘要:

热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠.文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondiiL.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员.利用生物信息学对雷蒙德氏棉HSP70基因的结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析,结果表明,HSP70基因家族根据亚细胞定位结果可分为不同的基因亚家族,各亚家族中HSP70基因具有相对保守的基因结构;染色体片段重复和串联重复是雷蒙德氏棉HSP70基因家族扩增的主要方式.通过对不同物种的HSP70基因家族进行系统进化分析可知,HSP70亚组的分化发生在单细胞植物形成前,且细胞质型HSP70成员大量扩增.比较陆地棉棉纤维发育不同时期的深度测序表达谱,发现HSP70基因可能参与棉纤维的生长发育.本研究结果有助于了解棉属植物HSP70基因家族的功能,以期为深入研究棉纤维发育过程中的分子调控机理提供基础.

英文摘要:

Heat shock 70 (HSP70) proteins are highly conserved molecular chaperones widely existed in the plant kingdom which are involved in cellular protein folding process.In this study,comprehensive evolutionary analyses of the Gossypium raimondii HSP70 gene family members are conducted and 30 HSP70 genes are identified.The gene structure,chromosome distribution,gene duplication and phylogenic evolution of this family are further analyzed.The results reveal that HSP70 family genes can be clustered into several major subgroups based on their sub-cellular locations,and the gene structures are relatively conserved in each subgroup.Both tandem duplications and chromosome segmental duplications are found to contribute to the expansion of HSP70 gene family.Evolutionary analysis of HSP70s in diverse species reveals that the differentiation of HSP70 subgroups occurred before the multi-cell and single-cell differentiation,with the cytoplasmic HSP70s multiple amplified.The expression pattern of HSP70 genes under series of fiber development stages indicates that many HSP70 genes may participate in fiber development processes including fiber initiation and elongation.This study provides the complete profiles of cotton HSP70 family genes for future study on their functions related to the molecular mechanisms of fiber development.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
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  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
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  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
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  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
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