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贝氏肩孔南极鱼基因组DNA提取方法改进的初步研究
  • ISSN号:1674-5566
  • 期刊名称:上海海洋大学学报
  • 时间:2013.3.15
  • 页码:168-172
  • 分类:S917[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]上海海洋大学海洋科学学院,上海201306, [2]上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室,上海201306, [3]农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站,上海201306, [4]国家远洋渔业工程技术研究中心,上海201306
  • 相关基金:国家自然科学基金重大研究计划培育项目(91131006)
  • 相关项目:南极冰鱼心血管发育和功能适应的分子进化研究
中文摘要:

由于南极鱼的体内存在抗冻蛋白,不同于一般鱼类,常规基因组DNA的提取较为困难。为建立南极鱼基因组DNA提取的有效方法,利用贝氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)为材料,采用改进的酚-氯仿法提取基因组DNA,与传统酚-氯仿法和快速试剂盒抽提法作对比,并通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计测定、以及PCR扩增等手段进行基因组DNA质量的检测。结果表明:利用改进的基因组DNA提取方法,从贝氏肩孔南极鱼获得的基因组DNA,电泳条带整齐明亮,A260/A280值接近1.80,适合后续的PCR扩增实验,可满足基于PCR技术的相关分子生物学实验需要。

英文摘要:

Since lots of antifreeze proteins exist in Antarctic fishes,it is quite difficult to acquire high quality genomic DNA by using normal genomic DNA extraction method.In order to establish an effective genomic DNA extraction technique for Antarctic fish,one kind of Antarctic fish,Trematomus bernacchii,was used as the experimental material,and three different kinds of genomic DNA extraction methods(the modified phenol-chloroform method,normal phenol-chloroform method and the genomic extraction kit method) were compared.The acquired genomic DNA was appraised by spectrophotometer,agarose gel electrophoresis,and PCR amplification.The results showed that we successfully obtained high quality genomic DNA from T.bernacchii by using our modified phenol-chloroform method.The gel bands were very neat and bright,the ratio of A260/A280 was around 1.80,and the acquired genomic DNA was suitable for PCR experiments.In a word,the extracted genomic DNA by using our modified phenol-chloroform method,was in good quantity and suitable for the PCR-based molecular experiment.

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期刊信息
  • 《上海海洋大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:上海市教委
  • 主办单位:上海海洋大学
  • 主编:陈裕东
  • 地址:上海市临港新城沪城环路999号
  • 邮编:201306
  • 邮箱:xuebao@shfu.edu.cn
  • 电话:021-61900229
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-5566
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2024/S
  • 邮发代号:4-604
  • 获奖情况:
  • 曾获《CAJ-CD规范》执行优秀奖,水产类期刊二等奖,全国优秀农业期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:3383