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猪源副黏病毒JL-1株全基因获得及遗传变异分析
  • ISSN号:1005-4545
  • 期刊名称:《中国兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.659.5[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春130062, [2]军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春130062, [3]中国农业大学动物医学院,北京100094
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30571375,30771606)
中文摘要:

利用本实验室分离保存的猪源副黏病毒JL-1株来提取病毒基因组RNA。参考GenBank发表的相关禽副粘病毒Ⅰ型(Avian paramyxovirus serotype1,APMV-1)基因组序列,设计了8对特异性引物,RT—PCR法分别特异性的扩增出病毒各基因片段,并将各目的基因片段回收纯化,将纯化后的PCR产物进行测序。测定结果得到NP、P、M、F、HN、La、Lb、Lc8段基因序列,利用DNAMAN软件进行拼接得到基因组全长cDNA序列(GenBank登录号:EU546165)。序列分析结果表明,PPMV JL—1株与各地代表株核苷酸同源性87.85%~99.78%,与鹅源新城疫(GPMV)ZJ-1、NA-1株核苷酸同源性分别为83.31%、83.46%,同时根据各毒株F基因开放阅读框前389个核苷酸序列绘制出系统发育进化树,结果表明PPMV JL-1株与LaSota同属于基因Ⅱ型,不同于基因Ⅶ型的ZJ-1和NA-1株的鹅源毒株。

英文摘要:

Porcine paramyxovirus(PPMV)strain JL-1 was separated and conserved by this laboratory. Using the DNAMAN,eight pairs of over lapping primers, which cover the whole genome of avian paramyxovirus serotype 1 (APMV-1) strain,were designed according to the nucleotide sequence reported. Eight over-lapping fragments were amplified by the RT-PCR. The complete genome after sequencing and splicing was logged in the GenBank(Number: EU546165). Sequence analysis results indicated that the homology of complete genome nucleotide sequence from NDV strains was between 87. 85% and 99. 78% by compared with representative strains from every local. Meanwhile,on the basis of the nucleotide sequence of F gene from each NDV strains in a 389 bp region, the phylogenetic tree was drew,that indicated porcine paramyxovirus virulent strain JL-1 belonged to genotype Ⅱ which was the same with virulent strain Lassota, but different from the traditional low virulent strain Lassota which belonged to genotype Ⅱ ,and goose paramyxovirus strains ZJ-1 and NA-1 ,which belonged to genotype Ⅶ.

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期刊信息
  • 《中国兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学
  • 主编:王哲
  • 地址:吉林省长春市西安大路5333号
  • 邮编:130062
  • 邮箱:xbcjvs@163.com
  • 电话:0431-87836531 87836534
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4545
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1234/R
  • 邮发代号:12-105
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,连续多次被评为全军优秀医学期刊一等奖,全国高校优秀自然科学学报评比一等奖,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18973