位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
全长家蝇抗菌肽基因diptericin的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1003-8280
  • 期刊名称:《中国媒介生物学及控制杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R318[医药卫生—生物医学工程;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]广东药学院基础学院病原生物研究所,广州510006, [2]广东药学院附属第一医院检验科,广州510080, [3]广东药学院药科学院
  • 相关基金:国家自然科学基金(30672670)
中文摘要:

目的克隆新的家蝇抗菌肽基因双翅肽(diptericin)的全长序列并对其进行相关生物信息学分析。方法根据本实验室已经克隆的家蝇抗菌肽基因diptericin片段设计1对引物,运用cDNA末端快速扩增技术(GeneRacer)、T-A克隆和序列测定,将所得序列与GenBank中已知的diptericin基因进行同源性分析。结果成功地从免疫诱导的3龄幼虫中得到一个全长433bp的基因cDNA,该全长cDNA具有完整的编码框,编码99个氨基酸,相关生物信息学分析结果表明,其与厩蜇蝇diptericinA基因的同源性最高,为77%。结论初步推断此全长cDNA是家蝇抗菌肽的一个新基因,可能广泛存在于蝇类昆虫中,为进一步研究其生物活性奠定基础。

英文摘要:

Objective To clone the full-length of diptericin gene from Musca domestica larvae and to analyze by bioinformatics. Methods A pair of primers were synthesized according to the known sequences of diptericin. Its full-length was amplified by GeneRacer rapid amplification of eDNA ends. PCR product was purified and sequenced by T-A cloning and sequence analysis. The sequence amplified in this study had the homology with the sequence registered in GenBank. Results There were 433 bp nueleotides in the full-length of eDNA, which had complete coding frame and could code 99 amino acids. The bioinformatics analysis showed that it had higher homology compared to diptericin from Stomoxys calcitrans, and the homology was 77%. Conclusion The full length of eDNA maybe a new gene of antibacterial peptide from M.domestica, widely existed in Musca. It will provide a basis for the further study of its bioactivity.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国媒介生物学及控制杂志》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国疾病预防控制中心
  • 主编:刘起勇
  • 地址:北京昌平区昌百路155号
  • 邮编:102206
  • 邮箱:bingmei@icdc.cn
  • 电话:010-58900731
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-8280
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1142/R
  • 邮发代号:18-265
  • 获奖情况:
  • 1995年获中华预防医学会出版质量奖,2000年中华预防医学会优秀期刊,河北省第六届评刊编辑部质量奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版)
  • 被引量:9667