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油页岩微生物总DNA的提取方法
  • ISSN号:1005-3026
  • 期刊名称:东北大学学报(自然科学版)
  • 时间:2014.4.15
  • 页码:588-592
  • 分类:TP274[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
  • 作者机构:[1]东北大学材料与冶金学院,辽宁沈阳110819, [2]东北大学生命科学与健康学院,辽宁沈阳110819
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(51204055);中国博士后科学基金资助项目(20100481205)
  • 相关项目:油页岩干酪根降解细胞工程菌的构建
中文摘要:

为建立油页岩微生物总DNA提取方法,以两矿区的6个样品为材料,采用SDS高盐、SDS液氮研磨、SDS反复冻融、SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法分别对总DNA进行提取.结果表明,各方法提取效果差异很大,改进的SDS高盐提取法效果最好,各样品均得到约23kb较完整片段,且产率显著高于其他方法,达91.44~386.85ng·g^-1干样;以未纯化的DNA为模板,对16SrDNA进行PCR—DGGE,得到了相应的扩增产物及DGGE指纹图谱,说明该法适合油页岩样品.SDS液氮研磨和SDS反复冻融提取法仅能得到部分样品总DNA,且产率和纯度较低,而SDS异硫氰酸胍和试剂盒提取法无DNA提出,不适合此类样品.

英文摘要:

In order to develop an appropriate method for extracting microbial total DNA from oil shales, 5 methods (SDS-high-salt extraction, SDS-grinding-in-liquid-nitrogen extraction, SDS repeated freeze-thaw extraction, SDS guanidinium isothiocyanate extraction and kit extraction ) were tested to extract total DNA of 6 different samples from two mines, respectively. The results showed that the total DNA extraction effects of five methods vary significantly. The improved SDS-high-salt extraction method is the best, which can obtain total DNA with about 23 kb length and 91.44 -386. 85 ng-g- 1 dry sample. The yield rate is significantly higher than other methods. Then, the total DNAs without purification process were used as amplification templates, and 16S rDNA was carried out PCR amplification and DGGE electrophoresis, the corresponding PCR products and DGGE fingerprint were obtained. This shows that the improved SDS-high-salt extraction method is suitable for oil shale samples. SDS-grinding-in-liquid-nitrogen extraction and SDS repeated freeze-thaw extraction are only able to extract microbial total DNA of part of the samples, and with low yield and purity. SDS guanidinium isothiocyanate extraction and kit extraction methods are not suitable for oil shale samples.

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期刊信息
  • 《东北大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:东北大学
  • 主编:汪晋宽
  • 地址:沈阳.南湖
  • 邮编:110819
  • 邮箱:
  • 电话:024-83687378
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-3026
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1344/T
  • 邮发代号:8-120
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊二等奖,教育部优秀高校自然科学学报一等奖二次,获原冶金部科技期刊质量评比一等奖三次,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23296