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栉孔扇贝内参基因稳定性研究
  • ISSN号:1673-5897
  • 期刊名称:生态毒理学报
  • 时间:2013
  • 页码:616-622
  • 分类:X171.5[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]大连海洋大学水产与生命学院,大连116023, [2]中国环境科学研究院国家环境保护河口与海岸带重点实验室,北京100012
  • 相关基金:国家自然科学基金(21177117);国家科技支撑计划(2010BAC69B02)
  • 相关项目:内分泌干扰物对水生无脊椎动物的生态毒理与机制研究
中文摘要:

合适的内参基因对准确定量目标基因表达水平非常重要。利用实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析了不同发育阶段和雌激素暴露条件下栉孔扇贝性腺组织中β-actin、β-TUB、EF-l α、18S rRNA和GAPDH 5个内参基因的表达水平,并利用RefFinder软件对其表达稳定性进行了分析。结果表明:在所考察的内参基因中,EF-l α在栉孔扇贝不同发育阶段和雌激素暴露下的表达均最为稳定,可作为定量目标基因表达水平的内参基因之一。

英文摘要:

Appropriate reference gene is very important to precisely quantify the target gene expression. In this present study, five reference genes mRNA expressions, including β-actin, β-TUB, EF-l α, 18S rRNA and GAPDH in Chlamys Farreri gonad , were quantified using real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Their expression stability was analyzed online using RefFinder software. The results showed that EF-l α expression was the most stable among these five reference genes in gonad of different development stages and estrogen exposure, suggesting that EF-lα is one of suitable reference gene for quantifying genes expressions in Chlamys Farreri gonad.

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期刊信息
  • 《生态毒理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生态环境研究中心
  • 主编:王子健
  • 地址:北京市海淀区双清路18号北京2871信箱
  • 邮编:100085
  • 邮箱:stdlxb@rcees.ac.cn
  • 电话:010-62941072
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5897
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5470/X
  • 邮发代号:2-303
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4571