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DNA编码的模型分析
  • 期刊名称:华中科技大学学报(自然科学版)P67-70
  • 时间:0
  • 分类:TP301.6[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] O157.6[理学—数学;理学—基础数学]
  • 作者机构:[1]武汉工业学院数理科学系,湖北武汉430023, [2]武汉工业学院机械系,湖北武汉430023, [3]华中科技大学控制科学与工程系,湖北武汉430074
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60403002);湖北省自然科学基金资助项目(2005ABA233,2006ABA272);湖北省优秀中青年科技创新团队计划资助项目;湖北省教育厅社科研究资助项目(2005q092);浙江省自然科学基金资助项目(ZJNSF-Y105654).
  • 相关项目:全信息粘贴DNA计算模型的研究
中文摘要:

提出了适应DNA计算的DNA编码问题.对等码长的DNA编码问题的数学模型进行分析.以优化码长作为目标,分析了约束条件.以杂交反应为核心将约束条件分为基本约束和控制生化实验的约束,而控制生化实验的约束包含组合约束和热力学约束.控制移动不匹配的下值才能控制杂交反应,由此改进了移动距离.引入窗口距离解决了错配总量和分布的控制问题.

英文摘要:

The DNA encoding is a pivotal step of DNA computing. DNA encoding problem fitting to DNA computing was put forward. At the same time, we study mathematics model of equal-length DNA encoding. First we put forward optimizing length of encoding as objective function. Then we study restriction conditions, which are foundation restriction conditions and controlling bio-chemistry experiment restriction conditions for hybridization. And the second restriction conditions contain combination restriction conditions and thermodynamic restriction conditions. Because only by controlling lower limit value of moving non-matching can control hybridization, moving distance is put ringt. In combination restriction conditions, we bring forward window distance in order to control number and distributing of error-match.

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