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Vif-APO相关的HIV－1病毒模型
  • ISSN号：0023-074X
  • 期刊名称：《科学通报》
  • 时间：0
  • 分类：S858.28[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构：[1]北京大学理论生物学中心,北京100871, [2]北京大学物理学院,北京100871, [3]北京分子科学国家实验室,分子动态与稳态结构国家重点实验室,北京大学化学与分子工程学院,北京100871
  • 相关基金：国家自然科学基金（10721403）、国家重点基础研究发展计划（2009cB918500）和国家高技术研究发展计划（2006AA020400）资助项目
作者： 王懿[1,2], 来鲁华[1,3]
关键词： 生化网络模型, 病毒宿主相互关系, HIV-1病毒, VIF, Apo, Gag, TAT
中文摘要：

病毒感染因子Vif对控制HIV-1病毒的感染能力非常重要，它通过和细胞抗病毒蛋白APOBEC家族（简写成APO）的相互作用，引发APO的快速降解从而阻止APO被包装到新生的病毒粒子中．在本论文中，我们提出一个数学模型来定量地描述这种典型的病毒-宿主相互作用．为检验该模型，我们将计算模拟结果和4组已发表的实验数据进行了对比．在此基础上进行了系统的参数敏感性分析和扰动分析，表明与APO相关的参数对于新生HIV-1病毒粒子的感染能力非常重要．我们发现病毒结构蛋白Gag的生成速率以及单位新生病毒粒子所需的Gag蛋白分子数目呈现出对高病毒粒子产生速率和低APO包装入新生病毒粒子程度的优化现象，并且模型中的许多参数只在较小的取值范围内对病毒才是有益的．我们还发现针对激活病毒RNA合成的调控蛋白Tat的小扰动会导致Vif和APO包装入新生病毒粒子的量呈现开关效应．这些发现将有助于理解HIV—1病毒的高突变率和潜伏现象，并为药物设计定位关键的靶标提供帮助．

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期刊信息
  • 《科学通报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院
  • 主编：周光召
  • 地址：北京东黄城根北街16号
  • 邮编：100717
  • 邮箱：csb@scichina.org
  • 电话：010-64036120 64012686
  • 国际标准刊号：ISSN：0023-074X
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1784/N
  • 邮发代号:80-213
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,美国数学评论（网络版）,美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:81792