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氨基酸序列集熵值计算工具实现及应用
  • ISSN号:1004-0374
  • 期刊名称:《生命科学》
  • 时间:0
  • 分类:TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] Q517[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,哈尔滨150001
  • 相关基金:哈尔滨兽医研究所所长基金(2006-A-01).
中文摘要:

氨基酸序列保守区和可变区分析是蛋白质结构和功能分析预测的关键环节。本研究根据该需求,编写了Entropy软件,实现了氨基酸序列集熵值计算、统计分析和优势序列模型自动生成等功能,并利用其对A型流感病毒血凝素氨基酸序列的特征进行了分析。该软件为氨基酸序列集保守性分析提供了可靠工具。

英文摘要:

Identification of conservative and variable regions of an amino acid sequence of a protein is important for predicting its structure and functions. Based on the purposes, an entropy computation software named Entropy, with functions of frequencies calculation of single amino acid residue and generation of conservative sequence, was designed and realized, and which was applied to analyze the features of amino acid sequence of hemagglutininprotein of influenza A virus. The software described in this study provides a useful tool for amino acid sequence analysis.

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期刊信息
  • 《生命科学》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:国家自然科学基金委员会生命科学部 中国科学院生命科学与生物技术局 中国科学院生命科学和医学学部 中国科学院上海生命科学研究院
  • 主编:王恩多
  • 地址:上海岳阳路319号31号楼B座403中国科学院上海文献情报中心
  • 邮编:200031
  • 邮箱:CBLS@SIBS.AC.CN
  • 电话:021-54922830
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-0374
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1600/Q
  • 邮发代号:4-628
  • 获奖情况:
  • 1996年获上海市优秀科技期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:9112