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食源亚历山大藻核糖体DNA分子特征及其产毒特性的遗传差异
  • ISSN号:1002-6630
  • 期刊名称:《食品科学》
  • 时间:0
  • 分类:TS201.3[轻工技术与工程—食品科学;轻工技术与工程—食品科学与工程]
  • 作者机构:华南农业大学食品学院,广东广州510642
  • 相关基金:广东省科技计划项目(2016A040403103);2015年度国家星火计划项目(2015GA780080);国家自然科学基金青年科学基金项目(31301445);华南农业大学精品资源共享课《食品微生物检验学》项目(bkjx2015058)
中文摘要:

亚历山大藻可代谢产生麻痹性贝毒素,对人类健康和食品安全造成严重威胁。以核糖体DNA为研究对象,利用生物信息学及计算机分析软件对食源亚历山大藻核糖体DNA的分子特征进行分析,并且对亚历山大藻的产毒特性进行遗传差异研究。聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增亚历山大藻核糖体18S r DNA-28S r DNA区域,利用DNAdist计算5.8S r DNA-ITS区域序列间距离值序数,同时,利用PCR-限制性片段长度多态性(restricted fragment length polymorphisms,RFLP)技术,对核糖体18S r DNA-28S r DNA进行测序分析,选择限制性内切酶MboⅡ绘制内切酶图谱。结果表明:亚历山大藻无毒株L35与产毒株在5.8S r DNA-ITS区域序列间核苷酸的差异值可达到0.201~0.488,与同属无毒亚历山大藻的核苷酸差异值〈0.004;通过酶切图谱特征条带可以准确地将不同亚历山大藻种产毒类型分3类,酶切图谱相似的藻种产生的毒素组分相同。因此,食源亚历山大藻产毒与否以及产毒类型体现为核糖体DNA遗传信息中存在显著差异。

英文摘要:

Paralytic shellfish poisoning could be caused by the toxin produced by Alexandrium strains, which seriouslythreatens human health and food safety. Molecular characteristics of ribosome DNA and toxic characteristics of foodborneAlexandrium species were analyzed by bioinformatics and computer analysis software. The 18S rDNA–28S rDNAregion was amplified by PCR method, and 5.8S rDNA-ITS region was calculated by using DNAdist program. Moreover, the18S rDNA–28S rDNA region was sequenced by PCR restricted fragment length polymorphisms (RFLP) method, and Mbo II wasselected for restriction endonuclease mapping. The results showed that nucleotide sequence differences in the 5.8S rDNA-ITSregion between non-toxic strain Alexandrium L35 and toxic strains could reach 0.201–0.448, while values 〈 0.004 werenoted among non-toxin strains. Toxin could be distinguished into three types by the characteristic bands of endonucleasemap, and toxin components were same if strains had similar endonuclease map. Hence toxin production ability and toxintypes of Alexandrium strains reflected significant genetic differences in ribosome DNA.

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期刊信息
  • 《食品科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:北京市食品研究所
  • 主编:孙勇
  • 地址:北京西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:foodsci@126.com
  • 电话:010-83155446-8006
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-6630
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2206/TS
  • 邮发代号:2-439
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,1986年原商业部重大成果三等奖,1997年国内贸易部优秀科技期刊三等奖,第三届中国出版政府奖提名奖,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:115579