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鳄蜥线粒体基因组全序列及其结构分析
  • ISSN号:0439-8114
  • 期刊名称:《湖北农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q953.3[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]广西师范大学生命科学学院、广西珍稀濒危动物生态学重点实验室,广西桂林541004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31360522);珍稀濒危动植物生态与环境保护省部共建教育部重点实验室项目(桂科能1301Z002)
中文摘要:

采用PCR扩增方法测定了鳄蜥(Shinisaurus crocodilurus Ahl.)线粒体基因组全序列。经测序其线粒体基因组全长16 585 bp,含有13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因和1个控制区。除tRNA-Ser(AGY)基因外,其余21个tRNA基因的二级结构均为典型的三叶草结构。鳄蜥的线粒体基因组碱基组成分别为:A(31.99%)、T(26.48%)、C(27.96%)、G(13.57%)。除了COI基因起始密码子是ATC,其余12个蛋白质编码基因的起始密码子都是ATG。9个基因(ND1,ND2,COI,ATP6,ATP8,ND4L,ND4,ND6,Cytb)均有完全的TAA、AGA或AGG终止密码子,其他4个基因终止密码子为不完整的TA(ND5)或T(COⅡ,COⅢ,ND3)。

英文摘要:

The complete nucleotide sequence of the mitochondrial genome of Shinisaurus crocodilurus was determined by PCR. The complete mtDNA from S. crocodilurus was 16 585 bp in length and contained 13 protein-coding genes, 2 rRNA genes, 22 tRNA genes, and 1 control region(D-loop). The 22 tRNA genes can be fold in the typical cloverleaf structure except tRNA-Ser(AGY)gene. The average nucleotide composition was 31.99% A, 26.48% T, 27.96% C and 13.57% G. Among 13 protein-coding genes of the S. crocodilurus mitochondrial genome, the common start codon(ATG) could be assigned as the start codon for all protein-coding genes except for COI which started with ATC. Most of the protein-coding genes including ND1,ND2,COI,ATP6,ATP8,ND4L,ND4,ND6,Cytb had TAA, AGA or AGG as termination codon,while COⅡ, COⅢ, ND3 and ND5 had incomplete termination codons TA / T.

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期刊信息
  • 《湖北农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖北省农业科学院
  • 主办单位:湖北省农业科学院 华中农业大学 长江大学
  • 主编:焦春海
  • 地址:武汉市武昌南湖瑶苑1号省农业科学院内
  • 邮编:430064
  • 邮箱:hbnykxxzz@126.com
  • 电话:027-87389334
  • 国际标准刊号:ISSN:0439-8114
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1255/S
  • 邮发代号:38-21
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,全国农业核心期刊,湖北省优秀期刊,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30537