利用细胞核微卫星(nuclear microsatellite,nSSR)标记对中国4个省的7个野生桂花[Osmanthus fragrans(Thunb.)Lour.]群体139个个体的遗传多样性和遗传结构进行了研究。11个微卫星位点揭示了野生桂花等位基因多样性(A)平均为6.039,有效等位基因数(Ne)平均为3.769,平均预期杂合度(He)为0.673。所有群体均显著偏离哈温平衡,近交系数FIS介于0.313~0.580之间。群体间遗传分化系数FST=0.143,AMOVA分析表明群体间遗传分化占总遗传变异的12.69%,群体内的遗传变异为87.31%。Mantel检验表明野生桂花群体间遗传距离与地理距离不存在相关性(r=–0.277,P=0.214)。STRUCTURE聚类分析显示,所有个体被划分为3个理论群体,庐山群体和浏阳群体中谱系较为单纯,而其他群体则存在一定程度的遗传混杂。瓶颈效应分析显示,除浏阳群体外所有群体经历了种群衰退。