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用于莱茵衣藻荧光定量PCR分析的内参基因选择
  • 期刊名称:植物生理学通讯 (2008) 45: 667-672
  • 时间:0
  • 分类:Q945.11[生物学—植物学] TP391.4[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]上海海洋大学水产与生命学院,上海201306, [2]南京大学生命科学学院,南京210093
  • 相关基金:国家自然科学基金(30771167)和上海市教育委员会重点科研项目(科06-411).
  • 相关项目:新基因or调节有色体形成的机理
中文摘要:

本文用GeNorm与NormFinder算法分析actin、α-tubulin、cblp和yptc1四个常用内参基因在不同处理下莱茵衣藻中的表达。结果显示,α-tubulin在各种条件下都有较好的表达稳定性,而以不同基因组合构成的多内参系统可能更有利于细胞周期短暂的单细胞绿藻的分析。

英文摘要:

The selection of reference genes plays a key role in the study of gene expression by real-time quantitative PCR. Using GeNorm and NormFinder algorithms, we studied the expression of four common-used reference genes, actin, a-tubulin, cblp and yptcl, in Chlamydomonas reinhardtii under different treatments. Our results showed that the expression of a-tubulin was relatively stable, but it might be more reliable to use a combination of different genes and utilize their normalization factor (NF) as a reference for analyzing the dynamic changing gene expression of unicellular green algae.

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