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基于最大间隔的基因表达规则筛选
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:《计算机工程与应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP181[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
  • 作者机构:[1]广东工业大学计算机学院,广州510006, [2]华南农业大学信息学院,广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金No.61070033; 广东省自然科学基金重点项目(No.9251009001000005); 计算机软件新技术国家重点实验室(南京大学)开放课题基金(No.KFKT2011B19); 广东省科技计划项目(No.2010B050400011 No.2010B080701070)
中文摘要:

通过基因表达数据发现与特定疾病相关的基因表达规则,对于疾病辅助诊断有重要意义。针对现有关联规则兴趣度度量的不足,提出了基于最大间隔的基因表达规则筛选策略。该筛选策略综合考虑了基因表达规则与同类及异类样本的距离,具有较强的基因表达规则筛选能力。结合最大间隔准则和递增式关联规则挖掘算法设计的关联规则挖掘算法,能够高效地发现Top-K最大间隔基因表达规则。在实际基因表达数据集上的实验结果,验证了最大间隔基因表达规则筛选策略的有效性和挖掘算法的高效性。

英文摘要:

Discovery of disease related gene expression rules is of great importance to the computer aided diagnosis.The max margin based interesting measure is proposed,which improves the generalization ability of association rules by taking both the distance among inner and outer classes into consideration.A Top-K max margin association rules mining procedure is also devised to efficiently discover the interesting rules in the high dimensional gene expression data.The experimental results show the effectiveness of the interestingness measure and the efficiency of the mining procedure.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国电子科技集团公司
  • 主办单位:华北计算技术研究所
  • 主编:怀进鹏
  • 地址:北京市海淀区北四环中路211号北京619信箱26分箱
  • 邮编:100083
  • 邮箱:ceaj@vip.163.com
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-8331
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2127/TP
  • 邮发代号:82-605
  • 获奖情况:
  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:97887