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生防绿针假单胞菌HT66中脂肽的鉴定与功能
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:微生物学通报
  • 时间:2017
  • 页码:611-619
  • 期号:03
  • 便笺:11-1996/Q
  • 分类:Q939.112[生物学—微生物学]
  • 作者地址:上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室;
  • 作者机构:上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室,上海200240
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31270084); 国家高技术研究发展计划项目(No.2012AA022107); 国家重点基础研究发展计划项目(No.2012CB721005)
中文摘要:

【目的】脂肽(Lipopeptide,LP)是微生物合成的一类重要的生物表面活性剂,不仅影响细菌的生物学功能,还对多种植物和人类病原菌具有广谱的拮抗作用。然而至今未见绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)中脂肽产物的报道。【方法】通过生物信息学手段预测绿针假单胞菌HT66中脂肽的氨基酸组成及顺序,构建脂肽合成基因缺失突变株HT66Δclp,根据突变株缺失代谢产物的UPLC/QTOF-MS信息验证预测结果,并研究了脂肽对该菌株的生长、吩嗪-1-甲酰胺(PCN)合成、生物膜形成和群集运动性的影响。【结果】预测菌株HT66的脂肽氨基酸顺序为L-Leu–D-Glu–D-allo-Thr–D-Val–L-Leu–D-Ser–L-Leu–D-Ser–L-Ile,通过比对野生型和突变株代谢产物的质谱信息确定该产物为黏液菌素(Viscosin);脂肽合成基因缺失后,菌株HT66的生长无明显变化,但其PCN合成、生物膜形成和群集运动性均有不同程度地下降。【结论】菌株HT66的脂肽产物为黏液菌素,对菌株的代谢、生物膜形成和运动性等生物学功能具有重要的调控作用。研究报道了绿针假单胞菌中一种脂肽分子的结构与功能,为研究其合成和调控机制及开发和应用奠定了基础。

英文摘要:

[Objective] Lipopeptides(LPs) are important biosurfactants produced by microorganisms and have significant influences on bacterial biological functions and broad-spectrum antagonistic abilities towards many botanic and human pathogens. LPs produced by Pseudomonas chlororaphis are not reported as yet. [Methods] This study predicted the composition and sequence of the amino acids within the LP produced by P. chlororaphis HT66. The LP biosynthetic genes deletion strain HT66Δclp was constructed, and subsequently the LP produced by strain HT66 was analyzed by the UPLC/QTOF-MS according to the lost metabolite in the mutant. At last, the roles of the LP on bacterial growth, phenazine-1-carboxamide(PCN) production, biofilm formation and swarming motility were studied. [Results] The amino acid sequence of the LP produced by strain HT66 was predicted to be L-Leu–D-Glu–D-allo-Thr–D-Val–L-Leu–D-Ser–L-Leu–D-Ser–L-Ile and the LP was verified to be viscosin via comparing the mass spectra data of the metabolites in the wild type and the mutant. Deficiency of LP was found to have no distinct effect on bacterial growth of strain HT66, however, the reduction in PCN production, biofilm formation and swarming motility were observed in the mutant. [Conclusion] The LP produced by strain HT66 is viscosin and it regulates several biological functions including metabolism, biofilm formation and motility. This study reported the structure and function of an LP produced by P. chlororaphis, which may be helpful in learning its synthesis and regulation mechanism and lay a foundation for its development and application.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487