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西花蓟马ISSR—PCR多态性引物及退火温度筛选
  • ISSN号:1001-3601
  • 期刊名称:《贵州农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S567.19[农业科学—中草药栽培;农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]云南农业大学植物保护学院,云南昆明650201, [2]云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明650201, [3]昆明学院农学院,云南昆明650214
  • 相关基金:国家自然科学基金项目“西花蓟马与本地近缘种对C02浓度升高的响应及生理机制”(31260450),“侵染云南花卉的凤仙花坏强斑病毒特性研究及风险性评估”(30960224);云南省教育厅科学研究基金项目“西花蓟马EST微卫星标记的开发及遗传多样性研究”(20122095);云南省科技创新团队计划“云南农业大学农业入侵生物可持续控制研究”(2011HC005)
中文摘要:

西花蓟马是近年来在我国局部地区爆发成灾的重要外来入侵害虫,为进一步研究西花蓟马的遗传多样性和种群遗传结构,对100条ISSR分子标记引物对西花蓟马基因组DNA的扩增情况进行了初步筛选,并利用4个地区的西花蓟马种群研究了其扩增多态性和最佳退火温度。结果表明:100条ISSR引物中有51条引物在西花蓟马基因组DNA中有扩增产物,其中,多态性引物12条,分别为UBC815、UBC834、UBC835、UBC840、UBC844、UBC845、UBC853、UBC864、UBC868、UBC874、UBC879和UBC899,其最佳退火温度依次为48℃、56℃、52℃、50℃、54℃、58℃、50℃、52℃、48℃、58℃、44℃和56℃。12条ISSR引物在4个地区的西花蓟马种群共检测到68个扩增位点,其中,多态位点31个,多态性比率(P)为45.59%;其遗传距离变化范围为0.132-0.338;在4个地区中,昆明和玉溪的西花蓟马亲缘关系最近。

英文摘要:

F. occidentalis is one of the invasive insect pests, which currently occurs in several provinces in China and causes serious economic loss in invaded regions. In order to study on the genetic diversity and population genetic structure in further, 100 inter-simple sequence repeat (ISSR) primers were screened in F. occidentalis and polymorphism primers were selected and the annealing temperatures were tested using four different populations of F. occidentalis. The results showed that 51 ISSR primers produced bands with F. occidentalis genome DNA, including 12 polymorphism primers, which were UBC815, UBC 834, UBC 835, UBC 840, UBC 844, UBC 845, UBC 853, UBC 864, UBC 868, UBC 874, UBC 879 and UBC 899, and the annealing temperatures of these polymorphism primers tested on F. occidentaliswere 48℃, 56℃, 52℃, 50℃, 54℃, 58℃, 50℃, 52℃, 48℃, 58℃, 44℃ and 56℃, respectively. Twelve ISSR primers were used to amplify four populations of F. occidentalis, and 68 discernible DNA fragments were produced, of which, 31 were polymorphic loci, and the percentage of polymorphic loci (P) was 45.59%. Genetic distance of the four F. occidentalis populations ranged from 0. 132 to 0. 338, and the population collected in Kunming and Yuxi have the closest genetic relationship.

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期刊信息
  • 《贵州农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:贵州省农业科学院
  • 主办单位:贵州省农业科学院
  • 主编:
  • 地址:贵阳市小河区省农科院内
  • 邮编:550006
  • 邮箱:gznk@263.net
  • 电话:3760719 3761720
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-3601
  • 国内统一刊号:ISSN:52-1054/S
  • 邮发代号:66-6
  • 获奖情况:
  • 中国科学引文数据库来源期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:25091