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人GJB2分子进化与耳聋遗传效应的关联性分析
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q111[生物学—普通生物学]
  • 作者机构:[1]南京医科大学临床医学院,南京210029, [2]南京医科大学基础医学院,南京210029
  • 相关基金:国家自然科学基金(31171217); 江苏省大学生科技创新基金(KY101J2010004)共同资助
中文摘要:

间隙连接蛋白β2(GJB2)基因突变与遗传性非综合征性耳聋密切相关,其广泛的突变类型及特异性的热点突变被认为是一种独特的致聋基因。本研究应用生物信息学方法对17个物种的GJB2蛋白进行了系统发育、保守性、跨膜区结构、三维结构和错义突变的分析,并结合已有报道的实验结果进行关联性分析。分析预测获得了166个固定的氨基酸位点、2个非保守区以及2个空间结构保守位点;关联性分析证实发生在保守位点的突变致病性高,非保守区突变的概率致病性小,跨膜区且改变氨基酸性质的突变,可能影响蛋白的空间结构而改变膜通道的通透性。本文为进一步研究GJB2基因突变与聋病的关联性及分子发病机制提供了理论依据,同时,这种研究思路对其它疾病的相关研究具有一定的借鉴价值。

英文摘要:

Gap junction protein β2 (GJB2) gene mutations are close associated with the hereditary non-syndromic hearing loss.Because of their wide mutation types and specific high frequency mutations,it was considered to be an unique deafness gene.In this research,GJB2 proteins were systematically studied with the means of bioinformatics including molecular phylogeny,conservation,transmembrane region,three-dimensional structure and missense mutation analysis,and also correlation analysis was carried out by combining some previous reported experimental results.166 amino acid fixed sites,two non-conserved regions and 2 sites of conserved spatial structure were predicted.Association analysis confirmed that high pathogenicity was the occurrence of mutations in the conserved sites,low probability of pathogenicity happened in non-conservative mutations as well.The mutations in transmembrane regions with the property of amino acid changing may affect the spatial structure of proteins leading to change the permeability of membrane channels.This study would provide a theoretical basis for further study of the deafness associating with GJB2 gene mutations and molecular mechanics of pathogenesis,and also the research ideas have a certain reference value for other diseases.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299