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黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的核酸检测与序列分析
  • ISSN号:1672-7347
  • 期刊名称:《中南大学学报:医学版》
  • 时间:0
  • 分类:R376.3[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]中南大学湘雅医院医院感染控制中心,长沙410008, [2]中南大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,长沙410078, [3]中南大学湘雅医院科研部,长沙410008, [4]黑龙江省牡丹江林业中心医院,黑龙江牡丹江157000
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)(20l0CB530201);国家杰出青年基金(30725032).
中文摘要:

目的:了解黑龙江林区野鼠中斑点热群立克次体的感染情况。方法:运用聚合酶链反应方法对黑龙江地区采集的啮齿动物标本扩增斑点热群立克次体外膜蛋白A(OmpA)基因。阳性标本送测序并应用Mega5.0软件进行序列分析。结果:共检测鼠标本514份,斑点热群立克次体的阳性率为9.3%(95%CI:7.1%~12.2%),牡丹江、绥芬河、同江和东宁四个地区斑点热群立克次体的阳性率分别为12.4%(39/314),5.3%(3/57),2.0%(1/51),5.4%(5/92),地区间阳性率差异有统计学意义(P=O.023)。感染斑点热群立克次体的有仓鼠、大仓鼠、大林姬鼠、褐家鼠、黑线姬鼠、红背鼠平、鼠句黯、棕背鼠平、东方田鼠、明纹花松鼠10种,鼠种间阳性率差异有统计学意义(P=O.002);棕背肝的阳性率最高,为22.1%(21/95)。测序结果显示鼠感染的斑点热群立克次体基因型是黑龙江立克次体基因型和一种新的未定种基因型。结论:黑龙江地区存在鼠感染黑龙江立克次体,同时可能存在未定种的新的斑点热群立克次体。

英文摘要:

Objective: To investigate the infection in spotted fever group Rickettsiae (SFGR) in wild rodents from Heilongjiang, China. Methods: Polymerase chain reaction (PCR) was used to detect the OmpA gene of SFGR in rodents collected in Heilongjiang. The PCR products amplified from rodent specimens were sequenced and compared with the corresponding part of the sequences deposited in the GenBank. Phylogenetic trees were constructed with Mega 5.0 software.Results: A total of S 14 rodents were collected from Heilong)iang during 2009-2011 and 11 species were included. The infection rate of SFGR in the rodents was 9.3% (95% CI: 7.1%-12.2%). Statistical analysis showed a significant difference in different areas of Heilong)iang (P=0.023). The highest prevalence was observed in Mudaniing area (12.42%). There were significant differences in different species of rodents (P=0.002). The infection rate of SFGR determined in Clethrionomys rufocanus was the highest (22.1%). Sequence analysis revealed SFGRbelonged to R.heilongjiangensis and a new unknown rickettsia genotype. Conclusion: R.heilongjiangensis has been presented in rodents in Heilongiiang, and a new SFGR genotype different from other rickettsiae genotypes may exist in this area.

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期刊信息
  • 《中南大学学报:医学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中南大学
  • 主编:李桂源
  • 地址:湖南省长沙市湘雅路110号 中南大学湘雅医学院75号信箱
  • 邮编:410078
  • 邮箱:xyxb2005@vip.163.com xyxb2005@126.com
  • 电话:0731-84805495 84805496
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-7347
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1427/R
  • 邮发代号:42-10
  • 获奖情况:
  • 省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,1992、1996年,中国生物医学核心期刊,中国期刊方阵双效期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
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