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柑橘黄龙病侵染相关抗病基因同源序列的克隆鉴定与表达分析
  • ISSN号:0529-1542
  • 期刊名称:《植物保护》
  • 时间:0
  • 分类:S436.661[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]重庆大学生物工程学院基因研究中心,重庆400030, [2]广西利添生物科技发展(合浦)有限公司,北海536128
  • 相关基金:国家自然科学基金(30971875)
中文摘要:

[目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP分析及克隆测序共得到5个NBS类抗病基因相似序列(RGAs)片段,在GenBank上登录号为HM777043~HM777047。通过Clustalx、DNAMAN等软件分析5个RGAs及其推导的氨基酸的相似性,结果显示它们均含有典型NBS-LRR类抗性基因所具有的保守区域:P-loop、Kinase-2a、GL-PLAL,其与已克隆的烟草N、亚麻L6、拟南芥RPS2、RPS5、RPP8、RPM1等抗病基因在保守区域氨基酸水平上的相似性为19.71%~42.86%。根据得到的序列设计特异性引物,对5个RGAs在HLB侵染过程中的表达进行定量PCR,结果显示嫁接病芽接穗后的8次连续采样中5个RGA的表达受到不同程度的调控。[结论]表明5个RGAs可能与黄龙病的侵染有关。

英文摘要:

[Objective] Resistance gene analogs were isolated from cDNA of plant tolerant to HLB and analyzed by expression.[Method] The resistance gene analogs were amplified from cDNA of Citrus maxima using degenerated primers based on the conserved regions of NBS(Nucleotide Binding Site)-LRR(Leucine Rich Repeat) domain from plant resistance genes cloned,and the quantitative Real-time PCR was used to check the expression of 5 RGAs.[Result] A total of 5 RGA fragments were successfully obtained,with GenBank accession numbers of HM777043-HM777047.The deduced amino acid of these RGAs were analyzed by Clustalx and DNAMAN softwares.Sequence analysis showed that these RGAs contained the conserved domains P-loop,kinase-2a and GLPL,which were conserved in NBS-LRR type disease resistance genes.The 5 RGAs shared 19.71%-42.86% identity with the resistance genes of tobacco N,flax L6,and Arabidopsis thaliana RPS2,RPS5,RPP8 and RPM1.The quantitative Real-time PCR results showed that expression of the 5 RGAs was different.[Conclusion] Therefore,it suggested that the 5 RGAs might be related with pathogen infection.

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期刊信息
  • 《植物保护》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国植物保护学会 中国农业科学院植物保护研究所
  • 主编:陈万权
  • 地址:北京圆明园西路2号中国农业科学院植物保护研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zwbh1963@263.net
  • 电话:010-62819059
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-1542
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1982/S
  • 邮发代号:2-483
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖提名奖(科技类),全国优秀科技期刊奖,中国科协优秀学术期刊奖,全国农业科技优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国农业科学院优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21665