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休眠解除过程中牡丹花芽均一化酵母杂交文库的构建
  • ISSN号:1672-1810
  • 期刊名称:植物遗传资源学报
  • 时间:2012.5.5
  • 页码:497-501
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]青岛农业大学生命科学学院,青岛266109
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30871728,31071828); 山东省农业良种工程项目(鲁科农社字[2007]217号)
  • 相关项目:PsMPT基因在低温解除牡丹休眠中的转录调控机制
中文摘要:

以不同低温处理的牡丹花芽为试材,采用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术结合SMARTTM(switching mecha-nism at 5'end of RNA transcript)建库技术合成cDNA,cDNA与pGADT7-Rec重组并转化酵母AH109,构建了冬季牡丹低温累积进程中的花芽均一化cDNA文库。经检测,原始文库滴度为1.77×106cfu/ml,库容量为2.3×108。对管家基因18S rRNA均一化前后丰度检测表明,均一化程度〉26,随机挑取了188个克隆,PCR方法测得文库重组率大于95%,插入片段平均长度1200bp,构建的文库质量较高。该文库为进一步通过酵母杂交技术筛选低温解除牡丹休眠进程中受低温调控的转录因子和互作蛋白,进而为构建低温解除休眠的基因调控网络奠定了基础。

英文摘要:

To obtain full-length genes related to dormancy release and provide resources for tree peony genomic study,flower buds of different chilling duration were used to isolate mRNA of tree peony.A normalized full-length yeast hybridization cDNA library was then constructed by DSN(duplex-specific nuclease) normalization method in combination with SMART(switching mechanism at 5′end of RNA transcript) technique.The amplified cDNA was recombined with pGADT7-Rec and transformed to the yeast strain AH109.The titer of un-amplified cDNA library was about 1.77×106cfu/ml,which contained 2.3×108independent clones.The results of PCR and Tanon GIS analysis indicated that the abundance of transcripts 18S rRNA decreased by 26in normalized cDNA library compared with that in non-normalized samples.The average size of cDNA inserts was 1200 bp with a recombination rate of over 95%.These results indicated that the normalized yeast hybridization cDNA library has been successfully established with high quality,which is convenient to screen transcription factors and interaction protein regulated by chilling temperature,and finally to develop gene regulation network during dormancy release in tree peony.

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期刊信息
  • 《植物遗传资源学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院作物科学研究所 中国农学会
  • 主编:刘旭
  • 地址:北京中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwyczyxb2003@163.com/sina.com/caas.cn
  • 电话:010-82105794 82105795
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-1810
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4996/S
  • 邮发代号:82-643
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:10278