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蛋白质水解酶和样品预处理优化技术在蛋白质组学研究中的应用
  • ISSN号：1000-3061
  • 期刊名称：生物工程学报
  • 时间：0
  • 页码：-
  • 分类：Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构：[1]西南林业大学生命科学学院,云南昆明650224, [2]军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心北京北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心,北京102206, [3]中国科学院微生物研究所,北京100101
  • 相关基金：国家高技术研究发展计划（863计划）（Nos.2011AA02A114,SS2012AA020502,2014AA020900,2014AA020607）;国家重点基础研究发展计划（973计划）（Nos.2011CB910600,2013CB911200）;国家自然科学基金（Nos.31470809,31170780）;北京市自然科学基金（No.5152008）;林业公益性行业科研专项（No.201304105）资助
  • 相关项目：利用SILAC定向筛选K63泛素连接修饰的蛋白质底物和K63泛素连接新生物学功能的系统研究
作者： 徐平|
关键词： 蛋白质组学, 蛋白质水解酶, 多种酶组合技术, 过滤器辅助样品制备技术, Proteomics, proteolytic enzyme, multi-enzyme combination, filter-aided sample preparation
中文摘要：

蛋白质组学是全景式鉴定、定量蛋白质,并研究蛋白质功能的学科。基于高分辨质谱的鸟枪法蛋白组学研究技术首先利用不同的位点特异性蛋白酶对复杂蛋白质样品进行酶解,进而利用质谱获得蛋白质相关的定性和定量信息。为了获得高质量的质谱信息,前期的样品处理和质谱数据采集同样重要。本文对蛋白组学中常用的Trypsin、Lys-C、Glu-C等位点特异性蛋白酶的酶切特点进行了总结,并综述了目前常用的几种酶切组合策略和样本预处理技术在提高蛋白质组学研究效率中的作用。

英文摘要：

Proteomics is a powerful subject focusing on large-scale study of protein structures and functions. A complete enzymatic digestion of protein complexes is the key step in modern high-resolution and high-throughput mass spectrometry（MS）-based identification and quantification. To achieve MS analysis, both peptide sample pretreatment and data acquisition are prerequisite in proteomic studies. In this paper, we summarized both the enzymatic proprieties of three common proteolytic enzymes, Trypsin, Lys-C and Glu-C, the optimization of multi-enzyme combination and an advanced sample pretreatment in proteomics research.

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期刊信息
  • 《生物工程学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编：杨胜利
  • 地址：北京市朝阳区大屯路中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编：100101
  • 邮箱：cjb@im.ac.cn
  • 电话：010-64807509
  • 国际标准刊号：ISSN：1000-3061
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1998/Q
  • 邮发代号:82-13
  • 获奖情况:
  • 北京市优秀科技期刊期刊奖,中国科协首届优秀学术期刊奖,2000年中科院优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘（网络版）,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:18441