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稻瘟病菌菌株FJ81278中新发现的一个基因注释及其表达分析
  • ISSN号:1671-5470
  • 期刊名称:《福建农林大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q933[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学生命科学学院, [2]福建农林大学计算机与信息学院, [3]福建农林大学植物保护学院,福建福州350002
  • 相关基金:国家公益性行业计划(200803008); 国家自然科学基金(30400260、3000111)
中文摘要:

对稻瘟病菌菌株FJ81278进行基因组和转录组分析,发现一个新的特异基因MoHsbA编码的蛋白具有疏水表面结合蛋白A(HsbA)结构域和一个信号肽.进一步的生物信息学分析发现,该基因组中另外7个基因编码的蛋白也具疏水表面结合蛋白结构域.稻瘟病菌中的HsbA蛋白聚集于系统发育树的同一个大的分支上,说明它们具有较近的亲缘关系.转录组和EST数据库中HsbA的表达情况不同,但在菌株GUY11侵染阶段基因芯片中均表现为上调.实时定量PCR分析表明,MoHs-bA在菌株FJ81278不同生长发育阶段均有表达,但在附着胞阶段表达量相对较高,推测该基因与附着胞的形成相关.研究结果为进一步揭示稻瘟病菌HsbA的生物学功能奠定了基础.

英文摘要:

To clone novel unigenes in Magnaporthe oryzae isolate FJ81278,we analyzed its genome and transcriptome data and found a unigene MoHsbA encoding protein with hydrophobic surface binding domain(HsbA) and a potential signal peptide.Further bioinformatics analysis showed that there were other 7 genes encoding proteins with HsbA domain.Interestingly,all these HsbA proteins were clustered in the same clade of the phylogenetic tree,suggesting they had close relation.In the transcriptome and EST database of M.oryzae,the HsbA genes had a diverse expression profiles,but they were all up-regulated genes based on microarray data of the isolate GUY11.However,our qRT-PCR results showed that MoHsbA expressed during all the growth and development stages,but with relative higher transcript level during appressorial development.Taking together,results will facilitate the understanding of the function of HsbA genes in M.oryzae.

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期刊信息
  • 《福建农林大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建农林大学
  • 主办单位:福建农林大学
  • 主编:兰思仁
  • 地址:福州金山
  • 邮编:350002
  • 邮箱:jfau@fafu.edu.cn
  • 电话:0591-83789300
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-5470
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1255/S
  • 邮发代号:34-16
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,第二届全国优秀科技期刊,全国高校优秀自然科学学报,华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9479