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用荧光显微示踪方法研究RecA在DNA同源识别过程中的工作机理
  • ISSN号:1000-3290
  • 期刊名称:物理学报
  • 时间:0
  • 页码:-
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]北京凝聚态物理国家实验室、中国科学院物理研究所软物质物理重点实验室,北京100190
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:10927402,11004234)资助的课题.
  • 相关项目:全内反射增强单分子磁镊装置
作者: 李明|
中文摘要:

RecA是原核生物体内参与DNA同源识别过程的一种关键蛋白, 长期以来一直是同源重组相关课题的重要研究对象. 通过荧光显微示踪方法, 发现在同源识别过程中 RecA与单链DNA形成的核蛋白丝与模板DNA的结合是短时(τ=0.2 s)和短程(l=1.05 μm)的, 结合后搜寻模板DNA上的同源位点的过程可分为布朗运动和定向运动两种模式. 结合时核蛋白丝并不是缠绕在模板DNA上, 而是以一种更弱的方式结合在模板DNA外侧进行位点搜寻. 如果在该过程中没有找到同源位点, 核蛋白丝就会脱离模板DNA, 并寻找下一次与模板DNA结合的机会, 重复以上过程.

英文摘要:

RecA plays an important role in homologous recognition in prokaryotes, and it has become a hot point in homologous recognition related research since its discovery. We establish an assay by combining total internal reflection fluorescence and flow stretching to visualize in real time the motion of single RecA-ssDNA filaments which are tagged with fluorescent beads. This enables us to study the interaction of RecA-ssDNA filaments with their templates in the homologous recognition process. It is found that the searching and binding is a short-time (τ=0.2 s) and short-distance (l=1.05 μm) process. Two distinguished motion modes for the RecA-ssDNA filament are observed, a Brownian motion and a directed motion. The observations suggest a model that a RecA-ssDNA filament just interacts weakly with the template DNA before it binds firmly to the template DNA. If no homologous site is found in a searching process, the filament drops off the template and repeats the searching process again until it finally finds its target.

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期刊信息
  • 《物理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国物理学会 中国科学院物理研究所
  • 主编:欧阳钟灿
  • 地址:北京603信箱(中国科学院物理研究所)
  • 邮编:100190
  • 邮箱:apsoffice@iphy.ac.cn
  • 电话:010-82649026
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3290
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1958/O4
  • 邮发代号:2-425
  • 获奖情况:
  • 1999年首届国家期刊奖,2000年中科院优秀期刊特等奖,2001年科技期刊最高方阵队双高期刊居中国期刊第12位
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49876