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菌根真菌诱导的铁皮石斛根差减cDNA文库构建
  • ISSN号:1001-2494
  • 期刊名称:《中国药学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R284[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院-北京协和医学院药用植物研究所,北京100193
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31170314);中国博士后科学基金资助项目(20080440328)
中文摘要:

目的构建菌根真菌共生诱导的铁皮石斛根的差减cDNA文库,从中筛选出差异表达基因。方法采用SMARTer PCR cDNA合成方法直接以总RNA为模板合成并富集稀少cDNA,再利用抑制消减杂交(SSH)方法构建受菌根真菌共生诱导铁皮石斛根的差减cDNA文库。结果成功构建了受菌根真菌诱导铁皮石斛根的差减cDNA文库,共获得1975个阳性克隆。经检测。90%以上克隆能扩增出有效产物,其插入片段大小在150~1000bp之间。随机挑取了20个克隆菌液测序并进行了比对分析,大部分为植物应对环境胁迫防御性基因。结论该技术体系所构建的差减cDNA文库质量较好,操作方便,尤其适用于珍稀濒危的植物材料。

英文摘要:

OBJECTIVE To screen differentially expressed genes on the roots of Dendrobium candidum induced by a symbiotic mycorrhizal fungus, the differential cDNA library was constructed. METHODS The ds cDNAs were synthesized and enriched by SMARTer PCR cDNA synthesis kit using total RNA of D. candidum roots symbiotic with the fungus as templates. The differential cD- NA library was constructed by using suppressive subtraction hybridization (SSH). RESULTS The differential cDNA library, contai- ning 1 975 clones in the storage capacity, was constructed successfully. It was detected that above 90% clones could be amplified ef- fective products. The lengths of the differential cI)NA fragments cloned were 150 bp to 1 kb by electrophoresis detection to 20 randomly selected clones. Then, the 20 ESTs similarity analysis based on BLASTx software was carried on and most of the cloned genes were the defensive genes of plant responding to environmental stresses. CONCLUSION Using this technology system could construct a fine differential cDNA library and be operated easily, especially suitable to the rare species.

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期刊信息
  • 《中国药学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国药学会
  • 主编:桑国卫
  • 地址:北京市朝阳区建外大街四号建外SOHO九号楼18层
  • 邮编:100022
  • 邮箱:zgyxzz@cpa.org.cn
  • 电话:010-58698009
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-2494
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2162/R
  • 邮发代号:2-232
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,第一、二届全国优秀科技期刊一等奖,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:54982