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重金属胁迫下稀有鲫抑制消减杂交文库的筛选与分析
  • ISSN号:1000-7083
  • 期刊名称:《四川动物》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院水生生物研究所,武汉430072, [2]中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室,武汉430072, [3]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30900154); 中国科学院水生生物研究所青年人才创新项目(Y15E011101); 中国长江三峡集团公司项目(0799522)
中文摘要:

重金属包括镉和铅等污染严重威胁人类健康。为从基因水平研究鱼类应答重金属胁迫的分子机理,本研究利用抑制消减杂交技术构建稀有鲫Gobiocypris rarus对镉处理反应的正、反向抑制消减文库。文库质量检测表明消减效率达210倍,通过对正、反向文库中部分表达序列标签进行序列测定,获得9条表达丰度较高的表达序列标签,平均长度为438 bp。利用快速扩增c DNA末端技术克隆获得核糖体蛋白s18(Rps18)基因的完整编码区,序列长度为525 bp,其中编码区459 bp,编码152个氨基酸,3’非翻译区38 bp,5’非翻译区28 bp。并利用实时荧光定量技术对Rps18基因在铅胁迫下的表达谱进行了研究,结果表明稀有鲫肝组织中Rps18基因的表达量变化较明显。

英文摘要:

Heavy metals,such as cadmium( Cd),lead( Pb),can pose serious toxin to human and aquatic organisms.Suppression subtractive c DNA library of Gobiocypris rarus treated by Cd was constructed to investigate the underlying mechanism. The efficiency of subtractive c DNA was reach up to 210 folds. A total of 9 expressed sequence tags with average sequence length of 438 bp and enriched in the c DNA library were obtained. The complete coding sequence of ribosomal protein s18( Rps18) from G. rarus was amplified by rapid amplification of c DNA ends technology,and it is found that this gene comprised of 5'-UTR( 28 bp),ORF region( 459 bp) that encoded 152 amino acids( aa) and 3 '-UTR( 38 bp).Then the expression of Rps18 in G. rarus after exposure to Pb was determined by real-time PCR,and the results showed that the expression difference of Rps18 was more obvious in liver than in muscle after Pb treatment.

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期刊信息
  • 《四川动物》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:四川省科学技术协会
  • 主办单位:四川省动物学会 四川省野生动物保护协会
  • 主编:岳碧松
  • 地址:成都市望江路29号四川大学生命科学学院内
  • 邮编:610064
  • 邮箱:scdwzz001@163.com
  • 电话:028-85410485
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7083
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1193/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 四川省首届优秀期刊评比获二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8319