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基于密度泛函理论的细胞色素P450 1A2抑制剂的定量构效关系
  • ISSN号:1674-9057
  • 期刊名称:桂林理工大学学报
  • 时间:2013.2.15
  • 页码:99-106
  • 分类:R91[医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]桂林理工大学化学与生物工程学院,广西桂林541004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(21167006); 广西科学基金项目(2011GXNSFA018061;2011GXNSFA018059); 环境化学与生态毒理学国家重点实验室开放基金项目(KF2011-21)
  • 相关项目:典型环境PBDE酶促代谢及其构效关系研究
中文摘要:

在B3LYP/6-31G*水平上采用高斯09全优化计算了50个P450 1A2抑制剂的量子化学参数,应用基于预测的模型变量选择方法(VSMP)选择描述子最佳子集,建立了最高轨道占有能(EHOMO)和分子体积(Vm)与萘、内酯衍生物及其他化合物对细胞色素氧化酶P450 1A2抑制剂的两变量线性QSAR模型,结果表明:所选的2个分子结构描述符与50个抑制剂的活性之间具有很强的线性关系(相关系数r2=0.907 0)和内部预测能力(留多法交叉验证相关系数q2=0.751 7)。同时,将50个化合物分成奇数集和偶数集各自进行筛选建模,并彼此进行外部预测,对全部样本集、奇数集和偶数集样本模型进行了y-Randomization检验,结果表明描述符EHOMO和Vm建立的模型均非常稳定并具有很高的预测能力。

英文摘要:

In order to establish the QSAR model of inhibitors of cytochrome P450 1A2,19 quantum chemical and thermodynamics parameters of 50 compounds,which include naphthalene,lactone and quinoline derivatives,are calculated at B3LYP/6-31G* level by density funcional theory method with Gaussian 09 program.Using VSMP(variable selection and modeling based on prediction) technique to select the optimal subset,a two-descriptor QSAR model is constructed.The results of modeling show that there is a strong linear relationship between two descriptors(energies of the highest occupied molecular orbital,EHOMO and the molecular volume,Vm) and the inhibited activity of 50 compounds(correlation coefficient of model,r2=0.907 0),and high inner predicted ability(correlation coefficient leave-multiple-out cross validation,q2=0.751 7).Meanwhile,50 compounds are divided into odd set and even set,and two-descriptor QSAR model are constructed with external validated by each other.Then,the y-Randomization validation is performed within the models of all compounds set,odd set and even set.The models of three sets built by EHOMO and Vm have stability and high prediction.

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期刊信息
  • 《桂林理工大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:桂林理工大学
  • 主办单位:桂林理工大学
  • 主编:张学洪
  • 地址:广西桂林市建干路12号
  • 邮编:541004
  • 邮箱:xbz@glite.edu.cn
  • 电话:0773-5896423
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-9057
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1375/N
  • 邮发代号:48-7
  • 获奖情况:
  • 2007年获第六届广西十佳自然科学期刊,2008年获第二届中国高校优秀科技期刊,2009年获第七届广西优秀自然科学期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1207