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用CODEHOP法设计简并引物克隆草鱼多聚免疫球蛋白受体基因片段
  • ISSN号:2095-1388
  • 期刊名称:《大连海洋大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S965.111[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学] Q512.2[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]山东省淡水渔业研究院山东省盐碱地渔业工程技术研究中心,济南250013
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31440090); 山东省农业良种工程项目; 山东省财政支持农业技术推广项目
中文摘要:

为克隆草鱼Ctenopharyngodon idellus多聚免疫球蛋白受体p IgR基因,本研究中借助于NCBI、Blast等数据库及Primer Premier 5.0、DNAMAN等生物软件,利用CODEHOP法设计了简并引物,并对克隆基因进行同源性比较和系统发生分析。结果表明:用CODEHOP法设计的简并引物特异性强,试验成功率高;草鱼p IgR基因属于整个脊椎动物的p IgR基因群,与鲤Cyprinus carpio同源性最高,为84%。

英文摘要:

The gene of polymeric immunoglobulin receptor (pIgR)of grass carp Ctenopharyngodon idellus was cloned by a pair of degenerate primers designed by CODEHOP, and by combined bioinfomnatics including NCBI, Blast and biological software such as Primer Premier 5.0 and DNAMAN, and the homology and phylogenetic tree of the clone ofplgR gene were analyzed in the PCR products. The results showed that degenerate primers designed by CODEHOP were characterized by specificity and benefit for the experiment accomplishing, plgR gene of grass carp was found to clustered into plgR gene group in all the other vertebrates, especially into the fish subgroup, with the maximal homology (84%) with common carp Cyprinus carpio.

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期刊信息
  • 《大连海洋大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:大连海洋大学
  • 主编:姚杰
  • 地址:大连市黑石礁街52号
  • 邮编:116023
  • 邮箱:xuebao@dlou.edu.cn
  • 电话:0411-84762672
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1388
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1575/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1995年全国高等学校自然科学学报系统优秀学报评比...,1995年全国高等农业院校学报“三优”评比一等奖,1998年全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1605