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微阵列数据的多目标免疫优化双聚类
  • ISSN号:1006-2475
  • 期刊名称:《计算机与现代化》
  • 时间:0
  • 分类:TP181[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程] TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]国防科学技术大学计算机学院,长沙410073, [2]中南林业科技大学计算机科学学院,长沙410004, [3]北京航空航天大学计算机学院,北京100083, [4]湖南农业大学信息科学技术学院,长沙410128, [5]中南林业科技大学图书馆,长沙410004
  • 相关基金:中南林业科技大学青年科学研究基金资助(0702613)和国家自然科学基金(60573057).
中文摘要:

DNA微阵列技术的发展为基因表达研究提供更有效的工具。分析这些大规模基因数据主要应用聚类方法。最近,提出双聚类技术来发现子矩阵以揭示各种生物模式。多目标优化算法可以同时优化多个相互冲突的目标,因而是求解基因表达矩阵的双聚类的一种很好的方法。本文基于克隆选择原理提出了一个新奇的多目标免疫优化双聚类算法,来挖掘微阵列数据的双聚类。在两个真实数据集上的实验结果表明该方法比其他多目标进化双聚娄算法表现出更优越的性能。

英文摘要:

The development of DNA microarray technologies provides an efficient tool for the experimental study of gene expression. Analysis of those large scale genomies data has initially focused on clustering methods. Recently, biclustering techniques were proposed for revealing submatriees showing unique patterns. Multi-objective optimization approach, which optimizes simultaneously several objectives in conflict with each other, is very good for solving biclustering problem. This paper proposes a novel multi - objective intmune optimization biclustering algorithm based on the clonal selection principle to mining biclusters from microarray data. Experimental are conducted on two real datasets, which shows that multi-objective immune optimization biclustering algorithm exhibits better and more stable performance than other multi - objective evolutionary biclustering algorithrns.

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期刊信息
  • 《计算机与现代化》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:江西省科学技术厅
  • 主办单位:江西省计算机学会 江西省计算技术研究所
  • 主编:刘波平
  • 地址:南昌市西湖区井冈山大道1416号8楼
  • 邮编:330003
  • 邮箱:jgsdd@163.com
  • 电话:0791-86490996
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-2475
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1137/TP
  • 邮发代号:44-121
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊 中国科技论文统计源期刊 江西省...
  • 国内外数据库收录:
  • 波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:14808