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基因宏阵列和荧光定量PCR方法对西瓜枯萎病害土壤中尖孢镰刀菌的快速检测和定量
  • ISSN号:0564-3929
  • 期刊名称:《土壤学报》
  • 时间:0
  • 分类:S154.38[农业科学—土壤学;农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学资源与环境科学学院,南京210095, [2]苏省固体有机废弃物资源化高技术研究重点实验室,江苏宜兴214200
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(40871126)资助致谢感谢美国罗格斯大学植物生理与病理系张宁博士对本试验中Macroarray技术的指导和帮助!
中文摘要:

采用基因宏阵列(Macroarray)和荧光定量PCR(Real—timePCR)的方法,对引起西瓜枯萎病害的病原菌尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum)进行了快速监测和快速绝对定量,并且对实验条件进行了优化和摸索。结果显示,在西瓜枯萎病害发病较为严重的处理N-+P-和N+P+的根际土壤中,Macroarray检测到强烈的阳性信号,表明尖孢镰刀菌的大量存在,同时荧光定量PCR的结果也表明在这两个处理的根际土壤中尖孢镰刀菌数量最多,分别为每g土壤8.89×10^5和2.24×10^5个拷贝数;而在未发生枯萎病害的处理N’+P-和N++P+中,Macroarray未检测到阳性信号,根际土壤中尖孢镰刀菌数量分别为每g土壤6.23×10^5和3.28×10^5个拷贝数;而四个处理的土体土壤中尖孢镰刀菌的数量均维持在每g土壤10^2~10^3个拷贝数,Macroarray未检测到阳性信号。与传统检测方法如病原菌的分离培养、平板稀释计数等相比,上述分子生物学方法对病原真菌的检测和定量更为准确快速、省时省力。

英文摘要:

Macroarray and Real-time quantitative polymerase chain reaction (Real-time PCR) methods were used to perform quick check and quick quantification of Fusarium oxysporum in soils infected with watermelon wilt disease, and their usage was optimized and studied in lab. Results show that in rhizospheric soils of Treatments N- + P-and N- + P + severely infected with the disease, the Macroarray System detected strong positive signals, indicating that Fusarium oxysporum existed in these soils in large quantity. The real-time PCR method also found that the number of Fusarium oxysporum in treatments N- + P-and N- + P+was the largest, being up to 8.89 ×10^5 dRn g^-1soil and 2.24 ×10^5dRn g^-1 soil, respectively, while in other two treatments not infected with the disease, the number was 6.23 ×10^3 dRn g^-1 soil and 3.28 ×10^3 dRn g^-1 soil. While in bulk soils of all the four treatments, the number of Fusarium oxysporum varied between 10^2 - 10^3dRn g^-1 soil, and the Macroarray System didn't detect any strong positive signals. Compared to the traditional isolation, culture, plate screening and counting method for identification and detection of pathogens, the two abovedescribed methods are accurate, instant, and time-and-labor saving.

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期刊信息
  • 《土壤学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国土壤学会
  • 主编:史学正
  • 地址:南京市北京东路71号
  • 邮编:210008
  • 邮箱:actapedo@issas.ac.cn
  • 电话:025-86881237
  • 国际标准刊号:ISSN:0564-3929
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1119/P
  • 邮发代号:2-560
  • 获奖情况:
  • 2003年荣获“百种中国杰出学术期刊”称号,2002年荣获“第三届华东地区优秀期刊奖”,2002年荣获“第三届中国科协优秀期刊二等奖”
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:40223