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宏蛋白质组学在活性污泥研究中的应用
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q93-31[生物学—微生物学] X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]天津大学化工学院,天津300072, [2]天津市职业与环境危害防制重点实验室中国人民武装警察部队后勤学院,天津300309
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(21477163)和天津市应用基础与前沿技术研究计划(重点项目)(14JCZDJC40400)资助
中文摘要:

宏蛋白质组学作为研究微生物群落的一种新兴技术,主要是对特定微生物群落所表达的全部蛋白进行宏观、高通量的分析研究.本文综述了宏蛋白质组学研究的技术路线,主要包括蛋白的提取和纯化、分离和鉴定,以及宏蛋白质组学在强化生物除磷的活性污泥、活性污泥胞外多聚物和比较不同处理工艺活性污泥的差异等方面的研究.活性污泥的宏蛋白质组学研究完善了强化生物除磷活性污泥的厌氧和好氧阶段的代谢模型,揭示了活性污泥胞外多聚物在污染物降解过程中的主要作用和表现,阐述了不同活性污泥在污水处理过程中宏观特性与微观功能之间的关系,对于污水的生物处理有着重要的指导意义.宏蛋白质组学在活性污泥研究领域仍处于起步阶段,没有统一、有效的蛋白提取方法,数据库匮乏,成为活性污泥宏蛋白质组学发展的主要阻碍.随着各种新兴仪器、方法的应用以及数据库的不断完善,活性污泥宏蛋白质组学将会在污染物生物降解机制分析、鉴定功能蛋白等方面展现其巨大的优势.

英文摘要:

Activated sludge is widely used as an effective and stable method in wastewater treatment. However a deep insight into the microbial communities and components of activated sludge is still a great challenge. The rapidly growing number of metagenomic sequences together with revolutionary advances in bioinformatics and protein analyses have opened completely new horizons to investigate the molecular basis of such complex communities. Metaproteomics, a new approach for studying functional microbial ecology, is mainly applied for macroscopical and high-throughput analysis of total proteins expressed by a specific microbial community. The research approach of metaproteomic is similar to the classical approach in proteomic analysis, including protein extraction and purification, separation and identification. Currently, activated sludge metaproteomics has made a great progress in research on enhanced biological phosphorus removal sludge, activated sludge extracellular polymeric substances and comparison of wastewater treatment processes. However, compared with the rapid development in bio-medical field, the research on activated sludge by metaproteomics is still in its infancy. The lack of a common effective protein extraction method and the imperfection of environmental microbial database became the biggest obstacle of the the application of metaproteomics in studies of activated sludge. This review summarizes the recent research advances both domestic and overseas, and compares the different methods of activated sludge metaproteomics. With the development of the new instruments and corresponding technologies, activated sludge metaproteomics will show its great advantages in study on the pollutant biodegradation mechanism and the proteins function identification.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016