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污损生物膜细菌Pseudoalteromonas issachenkonii YT1305-1的鉴定及其代谢物化学成分分析
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:微生物学通报
  • 时间:2014
  • 页码:1278-1286
  • 分类:Q73[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用所重点实验室,山东烟台264003, [2]烟台水产研究所,山东烟台264000, [3]中国科学院海洋研究所海洋环境腐蚀与生物污损重点实验室,山东青岛266071, [4]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:烟台市科技发展计划项目(No.2011063);中国科学院海洋环境腐蚀与生物污损重点实验室开放基金项目(No.MCKF201402);国家自然科学基金项目(No.41206154,21202198)
  • 相关项目:两种潮间带海绵中抗污损活性物质基础及协同效应研究
中文摘要:

【目的】对污损生物膜细菌YT1305-1进行菌种鉴定;研究其作为污损生物膜优势菌之一的代谢产物。【方法】通过16S rRNA基因序列分析,结合系统进化树和细菌生理生化实验对菌种进行鉴定,通过硅胶柱层析分离方法和核磁共振检测技术分析其代谢物的化学成分。【结果】发现生物膜中存在明显的优势菌株,假交替单胞菌属为优势菌属之一。16S rRNA序列比对分析表明Pseudoalteromonas issachenkonii为优势菌种之一,将目标菌种命名为Pseudoalteromonas issachenkonii YT1305-1,对其代谢物化学成分进行分析,共得到10个化合物,其中包括5个二酮哌嗪(DKPs)类信号分子,环(甘氨酸-丙氨酸) (1)、环(脯氨酸-甘氨酸) (2)、环(脯氨酸-酪氨酸) (3)、环(4-羟基-脯氨酸-亮氨酸) (4)和环(4-羟基-脯氨酸-丙氨酸) (5),以及尿嘧啶(6)、胸腺嘧啶(7)、胸腺嘧啶脱氧核苷(8)、己二酸二(2-乙基己)酯(9)和邻苯二甲酸二(2-乙基己)酯(10)。【结论】污损生物膜中存在明显的优势菌,其中之一为P. issachenkonii YT1305-1,在其代谢产物中发现了疑似信号分子的物质DKPs,有研究表明该物质能调控生物膜的形成,进而影响生物污损的形成,为探究生物污损现象奠定了物质基础。

英文摘要:

[Objective] Bacterium YT1305-1 was isolated and identified from biofouling biofilms. As one of the dominant bacteria in biofouling biofilms, metabolites of bacterium YT1305-1 were investigated. [Methods] 16S rRNA gene analysis, phylogenetic tree analysis and physiological and biochemical characteristics were carried on to identify the targeted bacterium. Chemical constituents of the bacterial metabolites were purified through silica column chromatography and identified using nuclear magnetic resonance (NMR). [Results] There existed dominant bacterial species in biofouling biofilms. Pseudoalteromonas sp. was identified as one of the dominant species in biofouling bacteria. 16S rRNA analysis showed P. issachenkonii was one the dominant bacterium. The targeted bacterium was named Pseudoalteromonas issachenkonii YT1305-1 and 10 chemicals were identified from its fermentation broth, including 5 Diketopiperazines (DKPs): cyclo (Gly-Ala) (1), cyclo (Pro-Gly) (2), cyclo(Pro-Tyr) (3), cyclo(Leu-4-hydroxyl-Pro) (4), cyclo (Ala-4-hydroxyl-Pro) (5) and uracil (6), thymine (7), thymidine (8), bis (2-ethylhexyl) adipate (9), phthalate esters (2-ethyl caproic) (10). [Conclusion] There existed bacterial species that were obviously dominant in quantitative terms in biofouling bioflims. Bacterium YT1305-1 was purified as one of the dominant bacterium. Analysis on its metabolites identified several DKPs, which might influence the formation of biofilms and further the development of biofouling. This investigation provides material basis for biofouling studies.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487