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少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶基因的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1004-1389
  • 期刊名称:《西北农业学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]石河子大学动物科技学院,新疆石河子832003, [2]中国农业科学院兰州兽医研究所,兰州730046
  • 相关基金:国家公益行业(农业)专项子课题(201303037-5); 国家自然科学基金(31260601); 兵团博士资金(2010JC09)
中文摘要:

为研究捕食线虫性真菌几丁质酶的功能,在国内首次对少孢节丛孢菌XJ-A1几丁质酶AO-801和AO-483基因进行扩增、克隆及测序,并对其编码蛋白信号肽、疏水性与亲水性、高级结构、功能域进行预测和分析。结果显示,2个不同蛋白均具有典型的几丁质酶催化区保守序列SXGGW和DGXDXDWE,属于糖苷水解酶18家族几丁质酶,无信号肽序列,表明这2个蛋白为非分泌型蛋白,二级结构以无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠为蛋白的主要结构元件,三级结构中有(α/β)8的圆桶形结构。系统发育分析表明,几丁质酶AO-801和AO-483与昆虫病原真菌几丁质酶的亲缘关系更为接近,说明它们所产生的几丁质酶在侵染宿主的过程中发挥着类似的功能,并且不同来源真菌几丁质酶根据分子质量的差异形成3个不同的进化分枝。

英文摘要:

In order to study the function of chitinase of Nematode-trapping fungi,the chitinase gene AO-801 and AO-483 were amplified,cloned and sequenced from Arthrobotrys oligospora XJ-A1,and the signal peptide,hydrophobicity and hydrophilicity,secondary structure,tertiary structure and functional domains of the encoded proteins were predicted and analyzed.The results showed that two different proteins have two prevalent conserved catalytic domains with the sequence of SXGGW and DGXDXDWE,belonging to the family 18 glycoside hydrolase.They have no signal peptide sequence,which indicates that both proteins is not a secretory protein.Random coils,alpha-helix and beta-sheet are the major structural elements in secondary structure of chitinase gene AO-801 and AO-483,and(α/β)8rounded buckets in tertiary structure.Phylogenetic analysis showed that the phylogenetic relationship of chitinase AO-801 and AO-483 is more close to the insect pathogenic fungi,they produce chitinase which plays a similar function in the infected host.Different sources of fungal chitinase formed three different evolutionary branches according to molecular size.

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期刊信息
  • 《西北农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 甘肃、宁夏、青海、新疆农(林)业科学院 青海、新疆畜牧(兽医)科学院及新疆农垦科学院
  • 主编:廖允成
  • 地址:陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学西林校区大铁10号信箱
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbnx@chinajournal.net.cn
  • 电话:029-87082760 87082010
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-1389
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1220/S
  • 邮发代号:52-111
  • 获奖情况:
  • 教育部科技司颁发的"优秀科技期刊二等奖"等
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:27312