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辣椒‘9704A’雄性不育特异基因hsf的克隆及表达分析
  • ISSN号:1007-1032
  • 期刊名称:《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:S641.3[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学] Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128, [2]湖南省农业科学院蔬菜研究所,湖南长沙410125
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31101425)
中文摘要:

对辣椒细胞质雄性不育系‘9704A'和其同核保持系‘9704B’早期花蕾转录组的Solexa测序结果进行分析,发现1个差异性表达基因,其在不育系中的表达比在保持系中的表达高10倍,该基因与番茄、葡萄、拟南芥中的hsf基因同源性分别为87%、73%和70%,推测该基因为辣椒的而妒基因。根据该基因序列设计引物,从辣椒‘9704A'中克隆该基因的全长及核心cDNA序列,克隆到的hsf全长与核心序列与转录组测序获得的序列一致,进一步分析表明,该基因属于矗妒基因家族成员。用定量PCR分析矗旷基因在‘9704A'和‘9704B’2种辣椒的根、茎、叶和晚期花蕾中的表达情况,结果表明,该基因在不育系叶组织的表达量为其在保持系叶组织表达量的13.7倍,在不育系晚期花蕾中的表达量也为其在保持系晚期花蕾的3倍,而在2种辣椒系的茎中的表达量都很低,在2种辣椒系的根中的表达量均较高。

英文摘要:

Transcriptom Solexa sequencing was conducted on pepper early flower buds of the CMS line '9704A' and its correspondence homonuclear maintainer line '9704B' previously. A gene that expressed 10 times higher in pepper cytoplasm male sterile (CMS) line '9704A' than it is in the maintainer line '9704B' was identified. Gene homology analysis of the cloned hsfgene showed that the gene shares 87% homology with the hsfin Solanum lycopersicum, 73% in Vitis vinifera and 70% in Arabidopsis thaliana. According to the gene sequence we designed the primers and cloned the core sequence and hsfcDNA in pepper '9704A'. Sequence analysis showed that the cloned hsfcDNA was consistent with transcriptom Solexa sequencing. Gene analysis showed that the gene is one of the plants hsfgene family members. The real-time fluorescence quantitative RT-PCR primers were designed and the RT-PCR of the gene was carried out with the compared tissues in '9704A' and '9704B', using actin as reference gene. The result showed that the hsfgene expression in '9704A' leaf is 13 times higher than it is in the maintainer line and in '9704A' later flower bud is 3 times higher. The gene expressed very low in the stems of the two materials while high in the roots.

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期刊信息
  • 《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南农业大学
  • 主办单位:湖南农业大学
  • 主编:官春云
  • 地址:长沙市芙蓉区农大路1号
  • 邮编:410128
  • 邮箱:zkb4618035@hunan.edu.cn
  • 电话:0731-84618035
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-1032
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1257/S
  • 邮发代号:42-157
  • 获奖情况:
  • 2006、2008、2010年连续三届全国高校精品科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17328