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利用90K基因芯片进行小麦旗叶相关性状的QTL定位
  • ISSN号:1009-1041
  • 期刊名称:《麦类作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学] S330[农业科学—作物遗传育种;农业科学—农艺学]
  • 作者机构:西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家重点基础研究计划项目(2014CB138100);陕西省自然科学基金项目(2015JM3094);陕西省重点科技创新团队项目(2014KCT-25)
中文摘要:

为了发掘影响小麦旗叶相关性状的QTL,以小麦骨干亲本周8425B与优良品种小偃81构建的包含102个家系的重组自交系(Recombinant inbred line,RIL)为材料,采用小麦90K SNP基因芯片技术和SSR标记对其进行分子标记检测,构建含有全基因组SNP和SSR 标记的高密度遗传图谱,并在4个环境下对小麦旗叶相关性状QTL进行检测。结果表明,所构建图谱含有6 949对多态性标记,其中,SNP标记6 910对,SSR标记39对,覆盖染色体总长度4 839.9 cM,标记间平均距离0.7 cM;A、B和D染色体组分别有2 085、4 677和187对标记,分别占总标记数的30.0%、67.5%和2.7%,标记间平均距离分别为1.0、0.6和0.8 cM。采用完备复合区间作图法共检测到22个旗叶性状加性效应 QTL,10个旗叶长 QTL 分布于 2A、3B、4B、5A、6B和7B染色体上,解释表型变异 7.900 3%-24.097 9%,除 [QX(Y15] Qfll2A1[QX)][KG-*3]能在2个环境中检测到外,其余均为单环境QTL;4个旗叶宽 QTL分布于2A、3A和5B染色体上,解释表型变异9.079 8%-16.539 6%,其中, [QX(Y15] Qflw2A1[QX)][KG-*3]在3个环境中均能检测到,解释表型变异12.482 6%-16.539 6%,为1个稳定的主效QTL;8个旗叶面积 QTL 分布于2A、3B、4B、5A、6B和7A染色体上,解释表型变异9.309 5%-30.498 1%,其中,3个QTL位于5A染色体上。此外,鉴定出3个分布于2A、5A和6B染色体上的 QTL富集区段。

英文摘要:

In order to carry out the quantitative trait loci(QTLs) of wheat flag leaf traits,in this study, QTLs for flag leaf traits were mapped using an available high-density 90K wheat SNP and SSR genetic linkage map developed from a recombinant inbred line(RIL) population of Zhou 8425B × Xiaoyan 81. A genetic map covering 21 wheat chromosomes was constructed,which contains 6 949 polymorphism markers(6 910 SNP and 36 SSR),with a total genetic distance of 4 839.9 cM and an average interval distance of 0.7 cM. A,B and D chromosomes posseed 2 085,4 677 and 187 polymorphism markers,accounting for the proportion of 30.0%, 67.3% and 2.7%, respectively. And the average interval distance of the markers were 1.0,0.6 and 0.8 cM, respectively. Using phenotypic data at two locations (Yangling and Anyang) in two years(2013-2014 and 2014-2013 growing seasons), 22 QTLs for flag leaf length(FLL),flag leaf width(FLW) and flag leaf area(FLA) were detected by inclusive composite interval mapping(ICIM) (LOD ≥ 2. 5). Among those QTLs, ten QTLs for FLL were mapped chromosome 2A,3B,4B,5A,6B and 7B with phenotypic variations ranging from 7. 900% to 24. 098 A stable and major QTL associated with FLL, Qfll2A-1 ,was detected in two environments,while other nine QTLs can be detected in only one environment. Four QTLs for FLW were found on chromosome 2A, 3A and 5B with phenotypic variations from 9. 080% to 16. 540%. A stable and major QTL associated with FLW, QflwgA-1 ,was detected in three environments with phenotypic variations ranging from 12. 483% to 16. 540%. Eight QTLs for FLA were mapped on chromosome 2A, 3B,4B, 5A,6B and 7A with phenotypic variations ranging from 9. 310% to 30. 498% and three of them were anchored on 5A chromosome. Three QTL enrichment sections of 2A,SA and 6B chromosomes were i- dentified.

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期刊信息
  • 《麦类作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 中国作物学会 国家小麦工程技术研究中心
  • 主编:孙其信
  • 地址:陕西省杨凌邰城路3号《麦类作物学报》编辑部
  • 邮编:712100
  • 邮箱:mlzwxb@163.com
  • 电话:029-87082032
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-1041
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1359/S
  • 邮发代号:52-66
  • 获奖情况:
  • 从2003年起被收录为国家科技部“中国科技核心期刊”,2002年获第三届全国优秀农业期刊一等奖,1999年获陕西省科技期刊一等奖,1995年获陕西省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13981