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水稻谷氨酸脱羧酶基因(OsGAD3)分子进化与表达分析
  • ISSN号:1671-5470
  • 期刊名称:福建农林大学学报(自然科学版)
  • 时间:0
  • 页码:156-160
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]上海师范大学生命与环境科学学院,上海200234, [2]福建农林大学农产品品质研究所,福建福州350002
  • 相关基金:上海市科委项目(075405117,09QFll401900,08391911800);福建省粮食重大专项(2008NZ0001-4);上海市教委项日(09ZZl38,J50401);国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08012-002B)和国家自然科学基金(30900110)资助.
  • 相关项目:甲基茉莉酸高效调控丹参酮生物合成的分子机理研究
中文摘要:

利用分子克隆技术从8个水稻品种中克隆到谷氨酸脱羧酶基因仉O3GAD3,并进行了相关的生物信息学及表达谱分析.结果表明,不同水稻品种O3GAD3的核苷酸序列差异性很小,都在l%以内,在氨基酸序列上都具有保守的结构域,在C末端均具有类似于OsGADl结合CaM的关键氨基酸位点,但不同于0sGAD2.系统进化树分析表明,不同水稻品种的OsGAD3在进化上可以分为粳稻和籼稻两大类,与水稻常规分类相一致.此外,对不同水稻品种的谷氨酸脱羧酶基因的表达谱分析发现,O3GADl、O3GAD2、O3GAD3、O3GAD4、和O3GAD5在测试的11种水稻叶片中都有表达,但表达特征存在一定的差异性,可能与品种特性相关.

英文摘要:

In this study, glutamate decarboxylase genes (OsGAD3s) were successfully isolated from 8 rice varieties by using molecu lar cloning techniques, then related bioinformatics and expression profiles were also analyzed. The results showed that there is low nucleotide sequence differentiation of less than 1% among OsGAD3s from different rice varieties. The OsGAD3s all contain CaM binding key amino acid sites on the C terminal, which is similar to OsGAD1 but rather than OsGAD2. Phylogenic tree analysis indi cated that different OsGAD3s can be divided into two subgroups of japonica and indica, which is consistent with conventional classi fication of rice. In addition, expression profile analysis indicated that OsGADI, OsGAD2, OsGAD3, OsGA1M and OsGAD5 were all expressed in the tested rice varieties with different levels, which may be associated with the varieties difference. The cloning and a nalysis of OsGADs in different rice varieties will lay a good foundation for further understanding of physiological roles of different GADs and breeding novel rice varieties rich in γ-aminobutyric acid (GABA) by metabolic engineering in the future.

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期刊信息
  • 《福建农林大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建农林大学
  • 主办单位:福建农林大学
  • 主编:兰思仁
  • 地址:福州金山
  • 邮编:350002
  • 邮箱:jfau@fafu.edu.cn
  • 电话:0591-83789300
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-5470
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1255/S
  • 邮发代号:34-16
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,第二届全国优秀科技期刊,全国高校优秀自然科学学报,华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9479