位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
差异表达驱动的微阵列数据降维策略
  • ISSN号:1002-3674
  • 期刊名称:《中国卫生统计》
  • 时间:0
  • 分类:R739.4[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]南京医科大学公共卫生学院,南京210029, [2]江苏省生殖医学重点实验室南京医科大学,南京210029
  • 相关基金:国家自然科学基金(30571619)高等学校博士学科点专项科研基金(20050312001)江苏省高校研究生科研创新计划项目(2006129)
中文摘要:

目的探究差异表达驱动的微阵列数据之降维策略。方法本文提出permutation检验和99.99%的下单侧可信区间相结合的策略用于“维度粗筛”,HotellingT2检验结合逐步筛选的策略用于寻求组间差异表达的“局部变量组合”。结果以“正常成年男子和精子运动能力低下者精子蛋白表达差异研究”之实例展示了该降维策略的实际应用效果,结果发现了“十个蛋白组合”在组间差异表达。结论本文提出差异表达驱动的微阵列数据降维策略是实用可行的。

英文摘要:

Objective To explore the strategy of dimension reduction driven by differential expression analysis for microarray data. Methods Permutation test followed by a lower 99.99 % confidence interval, was used for feature pre - selection, Hotelling T2 test with a stepwise search strategy was used to find subset of variables with the lowest p - values. Resuits With the above strategy, a subset of 10 proteins was identified as differentially expressed between asthenozoospermic patients and norm male adults. Conclusion Our strategy of dimension reduction driven by differential expression analysis for microarray data is feasible and practical.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国卫生统计》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 主编:孟群
  • 地址:沈阳市沈北新区蒲河路77号
  • 邮编:110122
  • 邮箱:zgwstj@126.com
  • 电话:024-31939626
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-3674
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1153/R
  • 邮发代号:8-39
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20780