高校内部审计机构的有效运作不仅关系到高校资产绩效,更关系到高级技术人才的培养和我国科技软实力的提升。为了提高高校内部审计机构的运作效率,从经济学"委托代理问题"出发,分析高校内部审计过程中的政府、高校领导、内部审计机构三方的委托代理关系,并从委托代理双方利益的不一致方面找出高校内部审计风险存在原因,针对性地从委托人角度提出风险防范的策略。