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赭纤虫eRF1识别终止密码子特异性功能位点分析
  • ISSN号:0253-2395
  • 期刊名称:《山西大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室,太原030006
  • 相关基金:国家自然科学基金(31172078);高等学校博士学科点专项科研基金(20111401110008)
中文摘要:

蛋白质翻译终止过程中第一类肽链释放因子(eukaryotic polypeptide release factor,eRF1)识别终止密码子,水解肽酰-tRNA酯键,释放新生肽链,但eRF1识别终止密码子的机制尚不清楚。纤毛虫eRF1识别密码子的特异性为研究该机制提供了理想的材料。分析了赭纤虫(Blepharisma japonicum)eRF1的N端结构域中与密码子识别有关的关键的氨基酸。预测发现赭纤虫和酵母eRF1的一些与密码子识别有关的氨基酸被磷酸化修饰的几率很高,且二者磷酸化修饰的氨基酸位点有所差异。利用点突变方法向赭纤虫eRF1的N端引入与酵母eRF1一致的磷酸化位点时(N23S/D25E/A70S/Q115E),其识别终止密码子的特异性发生改变,由UAA/UAG识别特异性转变为UAA/UAG/UGA三个密码子全识别。说明这些位点磷酸化可能参与调节eRF1识别终止密码子的功能。

英文摘要:

Eukaryotic polypeptide release factor eRF1 decodes the three stop codons and hydrolysis the ester bond of peptidyl-tRNA,leading to release of renascence polypeptide,however,the detailed molecular mechanism remains unknown.Variant codon species,such as ciliates,frequently exhibit altered stop codon recognition,which provide us model for elucidating the mechanism of stop codon recognition by eRF1.The key amino acids associated with codon recognition in N-terminal domain of Blepharisma japonicum eRF1(Bj eRF1)were analyzed in this study.We found that the score of phosphorylation of some amino acids in eRF1 fromBlepharisma and Saccharomyces cerevisiae(Sc eRF1)were relatively high,and modifying pattern of both eRF1 swere different.We introduced the phosphorylation site into Bj eRF1 according to Sc eRF1 pattern by using site-direct mutagenesis.The resulted mutant Bj eRF1(N23S/D25E/A70S/Q115E)could recognize three stop codons,suggesting these amino acids might be involved in regulation of stop codon recognition by eRF1.

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期刊信息
  • 《山西大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:山西省教育厅
  • 主办单位:山西大学
  • 主编:杨斌盛
  • 地址:太原市坞城路92号
  • 邮编:030006
  • 邮箱:xbbjb@sxu.edu.cn
  • 电话:0351-7010455
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2395
  • 国内统一刊号:ISSN:14-1105/N
  • 邮发代号:22-42
  • 获奖情况:
  • 边疆七年获山西省一级期刊荣誉(1993-1999)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5651