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苏尼特羊拷贝数变异的基因组分布特征研究
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193, [2]内蒙古农牧业科学院畜牧研究所,内蒙古呼和浩特010031
  • 相关基金:国家自然科学基金(30972094); 十二五863项目(2011AA100307-02); 国家现代农业产业-肉羊体系(CARS-39-04B); 内蒙古农牧业科学院青年创新基金(2011QNJJM07)
中文摘要:

本试验利用Illumina OvineSNP50 Bead Chip芯片对71只苏尼特羊进行了分型,共检测到134个拷贝数变异区域(copy number variation regions,CNVR),大小范围为29.48kb~1.30Mb之间,总长度达到25.95Mb。基因注释及功能分析结果显示,这些基因与嗅觉感官知觉、化学刺激的感官知觉、感官知觉、识别等环境应答有关。选取5个CNVR进行qPCR验证,其中3个CNVR得到验证。通过对苏尼特羊基因组拷贝数变异的分析可以进一步了解绵羊基因组结构的特点,为今后开展绵羊基因组结构变异与重要经济性状的关联研究提供参考。

英文摘要:

In this study,71 Sunite sheep were genotyped using Illumina OvineSNP50 Bead Chip array,a total of 134CNV regions(CNVR)across the genome were identified,which covered 25.95Mb of the sheep genome.CNVR size on autosomes range from 29.48kb to 1.30Mb.Functional indicated that the most genes overrepresented in environmental responses,which involved in sensory perception of smell,sensory perception of chemical stimulus,sensory perception,cognition.To confirm these findings,quantitative PCR(qPCR)was performed for 5CNVR and 3 of them were successfully validated.Our findings would be of help to underst and the sheep genome and provide preliminary foundation for investigating the association between important economic traits and CNV.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619