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小麦TILLING分析中CELⅠ酶切及PCR反应体系的优化
  • ISSN号:1672-1810
  • 期刊名称:《植物遗传资源学报》
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/国家农作物航天诱变技术改良中心,北京100081, [2]黑龙江省农业科学院生物技术研究所,哈尔滨150086, [3]中国农业科学院生物技术研究所,北京100081
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2012AA100402); 农业部农业公益性行业科研专项(201103007); 国家自然基金项目(31100610); 国际原子能机构项目(CPR5017); 哈尔滨市学科带头人项目(2007RFXYN054)
中文摘要:

在小麦中建立稳定的基于CELⅠ酶切的目的基因突变位点检测技术,有助于高通量鉴定目的基因片段的点突变及提高突变检测效率。本研究以冬小麦品种新麦18空间诱变SP2群体为材料,以小麦糯质基因Waxy为目标片段,通过优化基因组DNA提取方法、调整PCR反应体系中dNTP、Mg2+及引物浓度、改变目标片段CELⅠ酶切缓冲液成分,以及调整纯化过程中的空气相对湿度等方式,优化了小麦TILLING技术体系。在利用PVP-40法提取DNA过程中,研磨器振动频率提高到30/s,KAc溶液的反应时间延伸为20min时,基因组DNA质量和纯度最佳;在设定的浓度范围内dNTP和Mg2+浓度对产物影响差异不明显,均能高效扩增出目的条带。引物浓度对产物影响差异显著,最佳引物浓度为0.4μmol/L。20μl酶切体系中,最佳CEL I酶浓度为0.1U且利用超纯水代替CELⅠ缓冲液。最终在小麦中建立起了基于CELⅠ酶切的高通量TILLING筛选技术体系。

英文摘要:

CELⅠ-based TILLING(Targeting Induced Local Lesions In Genomes) platform is very useful for high throughput identification of point mutations within targeted genes and improvement of mutation-detected efficiency in wheat.The space-mutated Xinmai 18(Triticum aestivum L.) SP2 population was used with one SNP of Waxy gene in the population as a positive control.The TILLING protocol for wheat was optimized through improving the method of genomic DNA extraction,the concentration of dNTP,Mg2+,primers and CELⅠ buffer as well as experimental environment air humidity.It was found that through raising the grinding frequence to 30/s and prolonging the reaction time of KAc to 20min in genomic DNA extraction,the quality and purification of DNA were the best.The concentration of both dNTP and Mg2+ did not have any influence on PCR products within the set ranges,while primer played an important role in PCR products and the best concentration was 0.4μmol/L.Optimum amount of CELⅠ enzyme was 0.1U in a 20μl of digestion reaction system and ultrapure water substituting for CELⅠ buffer was the best reaction condition.A CELⅠ-based TILLING technique for wheat was established and optimized.

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期刊信息
  • 《植物遗传资源学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院作物科学研究所 中国农学会
  • 主编:刘旭
  • 地址:北京中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwyczyxb2003@163.com/sina.com/caas.cn
  • 电话:010-82105794 82105795
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-1810
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4996/S
  • 邮发代号:82-643
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:10278