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大叶黑桫椤及桫椤SSR标记的开发
  • ISSN号:0529-6579
  • 期刊名称:《中山大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q347[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]中山大学生命科学学院,广东广州510275, [2]南京农业大学生命科学学院,江苏南京210095, [3]华南农业大学生命科学学院,广东广州510642, [4]深圳市中山大学研究所,广东深圳518057
  • 相关基金:国家自然科学基金(31370364,31570652,31670200);广东省自然科学基金(2016A030313320);深圳市科技创新(JCYJ20160425165447211).
中文摘要:

大叶黑桫椤是桫椤科的大型树蕨,多分布在亚热带山地,为渐危种。迄今为止,鲜有大叶黑桫椤种群遗传变异的报道。采用FIASCO法开发了大叶黑桫椤15个SSR标记,用来自海南岛的4个种群检测标记的多态性。其中,7个标记具多态性,每个标记的实际等位基因数为1~9,观察杂合度和期望杂合度范围分别为0~0.769和0~0.805。位点AG-12和AG-23分别在HNjfl和HNbwl种群显著地偏离哈代温伯格平衡。鉴定出4个哑等位基因。发现3对标记存在连锁不平衡现象。此外,4个S S R标记能成功地用于桫椤种群的遗传分析。这些新的多态性SSR标记将用于大叶黑桫椤的群体遗传变异、局部适应性的研究以及建立有效的保护策略。

英文摘要:

Alsophila gigantea is a large frond tree fern in family Cyatheaceae.The plant is a vulnerable species that prefers specific subtropical montane climate.Little work has been done so far to access the population genetic variation in A.gigantea.In this study,we developed 1 5 SSR markers using FIASCO protocol and evaluated these markers in four natural populations from Hainan Island,China.Seven loci proved to be polymorphic.The actual number of alleles ranged from one to nine,and the observed and expected heterozygosity varied from 0 to 0.769, and from 0 to 0.805 ,respectively.Loci AG-1 2 and AG-23 were found to significantly deviate from the Hardy-Wein-berg equilibrium in populations HNjfl and HNbwl,respectively.Four null alleles were identified.Linkage disequi-librium was further detected at three pairs of loci.Moreover,four SSR markers were verified to be successfully transferred in Alsophila spinulosa.The novel polymorphic SSR markers characterized here will be used to survey population genetic variation and local adaptation in A.gigantea,which helps design effective conservation strate-gies.

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期刊信息
  • 《中山大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:中山大学
  • 主编:王建华
  • 地址:广州市新港西路135号
  • 邮编:510275
  • 邮箱:xuebaozr@mail.sysn.edu.cn
  • 电话:020-84111990
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6579
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1241/N
  • 邮发代号:46-15
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期...,广东省优秀科学技术期刊一等奖,《中文核心期刊要目总览》综合性科技类核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18509