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种子植物抗细胞凋亡DAD基因的演化
  • ISSN号:1674-3466
  • 期刊名称:《植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q516[生物学—生物化学]
  • 作者机构:曲阜师范大学生命科学学院,曲阜273165
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.31570218)
作者: 包颖, 梅玉芹
中文摘要:

抗细胞凋亡基因(DAD)是一个高度保守的细胞凋亡抑制基因,在植物生长发育中承担重要功能。为全面了解DAD基因在种子植物中的分布和演化规律,该文利用31种植物的全基因组数据,通过生物信息学手段,深入探讨和分析了不同植物类群中DAD基因的拷贝数目、基因结构和染色体定位,并综合另外7种裸子植物的转录组数据探讨了其在种子植物中的演化趋势。结果表明,DAD基因属于低拷贝基因,在不同种子植物中只具有1–3个拷贝;不同DAD基因编码的氨基酸长度在108–170 aa之间变动。同线性和系统发育分析进一步表明,种子植物DAD基因的演化具有明显的谱系特异性。随机复制和染色体大片段复制及其随后的基因丢失可能是其维持低拷贝的重要方式。

英文摘要:

Defender against apoptotic death (DAD) is a highly conserved cellular apoptosis gene and plays an important role in seed plant growth and development. To fully understand the evolutionary pattern of the DAD gene in seed plants, based on the whole genome data of 31 plants, we analyzed copy number, structure, chromosome location of the DAD genes by using bioinformatics. In addition, along with transcriptome data for seven gymnosperms, we discuss the evolutionary trend of the genes in seed plants. The DAD gene is a low-copy gene with only 1-3 copies in different seed plants, and the length of different DAD protein varies from 108 to 170 aa. Phylogenetic and syntonic analyses further showed that the evolution of the DAD gene in these seed species has a lineage-specific characteristic. Random and block duplication and subsequent gene loss were possibly important ways to maintain the low-copy number of DAD genes in seed plant genomes.

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期刊信息
  • 《植物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院植物研究所 中国植物学会
  • 主编:种康
  • 地址:北京东香山南辛村20号
  • 邮编:100093
  • 邮箱:baiyuhong@ibcas.ac.cn
  • 电话:010-62836131 62836135
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-3466
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5705/Q
  • 邮发代号:2-967
  • 获奖情况:
  • 2000年中国科学院优秀期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:4109