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新城疫病毒溶瘤株SH15全基因组序列的测定及分析
  • ISSN号:1673-4696
  • 期刊名称:《中国兽医科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.659.5[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华南农业大学兽医学院,广东广州510642, [2]中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31572585)
中文摘要:

以上海某鸡场分离的1株对LoVo细胞及A549细胞具有良好的溶瘤效果且呈时间依赖性的新城疫病毒(Newcastle diseases virus,命名为SH15)为研究对象,依据Gen Bank中Mukteswar毒株,设计了10对引物以用于扩增SH15的片段cDNA,并对阳性克隆进行菌液PCR鉴定以及测序分析。测序分析比对结果确定,SH15株的全基因组长15 186 bp,在GenBank登录号为KY247177,结合生物学试验确定为中等毒力型。与其他毒株序列分析表明:该毒株与JS/9/05/Go、Mukteswar的全基因组同源性为99.8%,属于NDV的ClassⅡ分支中的基因Ⅲ型。推测SH15的溶瘤能力可能与HN蛋白中H203位点变异有关。本研究为了解新发现的溶瘤NDV毒株的生物学特性及全基因序列,以及以NDV为载体进一步开发肿瘤靶向药物奠定了基础。

英文摘要:

The oncolytic strain of Newcastle disease virus(NDV)SH15 was used as material due to its good oncolytic effect on LoVo cell and A549 cell in a time-dependent manner. Ten pairs of primers were designed according to Mukteswar strain in GenBank and positive clones were screened by RT-PCR. Sequence analysis showed that the length of SHI5 was 15 186 nucleotides(GenBank accession No. KY247177),and pat- hogenicity tests indicated SHI5 belonged to Mesogenic strain. Phylogenetic analysis showed SH15 was classified as genotype III of Class II ,and its homology with JS/9/05/Go and Mukteswar strain was up to 99.8%.The H203 site of HNprotein may be the key to oncolytic effect of SHl5. The present study facilita- tes the further studies on the new isolated NDV strain,even development of antineoplastic targeted drugs based on NDV.

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期刊信息
  • 《中国兽医科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院兰州兽医研究所
  • 主编:殷宏
  • 地址:兰州市盐场堡徐家坪1号
  • 邮编:730046
  • 邮箱:zgsykx@zgsykx.com
  • 电话:0931-8310086 8342195
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-4696
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1192/S
  • 邮发代号:54-33
  • 获奖情况:
  • 2003年获第二届国家期刊奖百种重点期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6141