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南极中山站排污口土壤中微生物群落的DGGE分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q938[生物学—微生物学] X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]厦门大学生命科学学院,福建厦门361005, [2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005, [3]国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室,福建厦门361005
  • 相关基金:国家自然科学青年基金资助项目( No. 40406029) Supported by the National Natural Science Youth Foundation of China (No. 40406029)
中文摘要:

以南极中山站排污口土壤为研究对象,提取样品中微生物宏基因组DNA,用变性梯度凝胶电泳(DGGE)对宏基因组DNA中的16SrRNA基因V3可变区进行分析,测定了31个不同条带所代表的序列,比较结果显示,排污口土壤样品与相同生境对照样品中的微生物类群组成均以CFB(Cytophaga—Flexibacteria—Bacteroides)类群和γ-变形菌纲(γ—Proteobacteria)为主,另外还有少量的α-,β-,δ-变形菌纲,和一些原核的藻类和革兰氏阳性细菌(G^+),但在排污口土壤样品中检出了传染性微生物毛球菌属(Trichococcus)和狡诈菌属(Dolosigranulum),以及丰富的小球藻(Chlorella),说明污水的排放已经对该地微生物群落造成明显的影响。图2表2参18

英文摘要:

The study of Antarctic microbial ecology plays a key role in the understanding of the human-caused impacts on Antarctic environment. In this study, an investigation was conducted on the microbial community in the sewage contaminated soil in the Zhongshan Station, Antarctic. Metagenome DNA was directly extracted and purified from the samples. Denaturing gradi- ent gel electrophoresis (DGGE) was used to analyze the V3 region of 16S rRNA gene. A total of 31 bands were separated from denaturing gradient gel and sequenced. The results of sequence comparison showed that the microbial community in both sewage contaminated soil and normal soil samples were all mainly consisted of CFB group and γ-proteobacteria, as well as other minor microorganisms including α-, β-, δ-proteobacteria, algae and low G + C Gram positive ( G^ + ) bacteria. However, the enriched Chlorella and the existed infective pathogens ( Trichococcus pasteurii and Dolosigranulum pigrum) in the sewage contaminated soil obviously indicated that sewage discharge had already affected the microbial community in this area. Fig 2, Tab 2, Ref 18

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016