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对细菌中2-氧化戊二酸依赖型加氧酶系存在性的分析
  • ISSN号:0490-6756
  • 期刊名称:《四川大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q81[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(30671165,2007AA021304-1)Acknowledgments We wish to express sincere appreciation to Prof Ding X P, whose critical eye, andenlightened mentoring was instrumental and inspiring.
中文摘要:

2-酮戊二酸,铁离子和维生素C是氧化戊二酸依赖型加氧酶辅助因子.有的细菌缺少维生素C,因此可能不含维生素C独立体酶,为了确定细菌中是否含有这种酶系,本文首先利用生物学软件ClustalX,PHYLIP,MEME/MAST和HMMER在植物和动物体内验证这个酶系的系统发育关系和保守序列,然后利用那些保守序列可以用来检测细菌是否含有这种酶.分析表明细菌中确实含有2-氧化戊二酸依赖型加氧酶酶系.

英文摘要:

The 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase (2ODD) family has a character requiring 2-oxoglutarate, iron ion and ascorbate as essential co-factors. The 2-oxoglutarate and iron-binding sites must be conserved in this super family. Bacteria probably lack ascorbate (Vitamin C) ; hence, they may not have the ascorbate-dependent forms of enzymes. To identify if it exist in bacteria, software predicting measures identified relationship and conserved sequences of this family in plants and animals were used, and then those conserved sequences can be used to determine if bacteria have this family enzyme.

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期刊信息
  • 《四川大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:四川大学
  • 主编:刘应明
  • 地址:成都九眼桥望江路29号
  • 邮编:610064
  • 邮箱:
  • 电话:028-85410393 85412393
  • 国际标准刊号:ISSN:0490-6756
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1595/N
  • 邮发代号:62-127
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,四川省十佳科技期刊,教育部全国高校优秀学报二等奖(1995,1999),四川省科技优秀期刊一等奖(1996,2000)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10542