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致病疫霉菌无毒基因AVR3a的克隆与序列分析
  • ISSN号:1008-0384
  • 期刊名称:福建农业学报
  • 时间:0
  • 页码:235-238
  • 语言:中文
  • 分类:S435.32[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]福建农林大学植物保护学院,福建福州350002, [2]福建省农业科学院植物保护研究所,福建福州350013
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30600401);农业部公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-053);福建省农业科学院青年科技人才创新项目(闽农科院发[2006]157号);福建省财政专项福建省农业科学院科技创新团队建设基金(STIF-Y07)
  • 相关项目:致病疫霉菌的群体遗传结构及其变异机制
中文摘要:

根据GenBank中致病疫霉菌无毒基因AVR3a序列(AJ893357)及参考文献中的特异引物(Pex147F,Pex147R),以致病疫霉菌基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到了特异性扩增片段,并对特异片段进行纯化和测序。结果表明,该片段的长度为451bp,经序列分析表明,其氨基酸编码序列为441bp,共编码147个氨基酸。BLAST分析结果显示,该片段核苷酸序列与无毒基因AVR3a核苷酸序列的同源性为99.34%,氨基酸序列比对结果表明,氨基酸序列在第19、80和103位存在着差异,这些核苷酸序列差异以及某些关键氨基酸的改变有可能是导致不同菌株中AVR3a毒性变异的原因。

英文摘要:

Based on the AVR3a DNA sequence for Phytophthora infestans found in GenBank (accession No. AJ893357) and its primers (Pex147F, Pex147R) reported in references, PCR was carried out with the genomics DNA of P. infestans as template. The specific fragment was purified and cloned. The results showed that the fragment was 451bp. And, the analysis of sequence indicated that the coding region was 441bp and encoded 147 amino acids. The specific fragment sequence of P. infestans shared homology of 99.34% with AVR3a gene sequence. The alignments of amino acids showed that there were three amino acids at position 19, 80 and 103 that were different from that of AVR3a. This seemed to be the reason for the variation in virulence of AVR3a in different isolates of P. infestans.

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期刊信息
  • 《福建农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:福建省农业科学院
  • 主办单位:福建省农业科学院
  • 主编:刘波
  • 地址:福州市五四路247号省农科院高新大楼401
  • 邮编:350003
  • 邮箱:fjnyxb@163.com
  • 电话:0591-87869455
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-0384
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1195/S
  • 邮发代号:34-56
  • 获奖情况:
  • 福建省第二届优秀科技期刊二等奖,第二届华东地区优秀期刊奖,全国优秀农业期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9962