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10个菲律宾蛤仔野生群体的遗传多样性研究
  • ISSN号:0029-814X
  • 期刊名称:《海洋与湖沼》
  • 时间:0
  • 分类:S917.4[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]中国科学院海洋研究所,青岛266071, [2]中国科学院大学,北京100049, [3]中国海洋大学,青岛266003
  • 相关基金:国家自然科学基金项目,40406032号,40876084号,31101898号,31000948号;中国科学院战略性先导科技专项,XDA1102030304号;中国科学院海洋研究所“一三五”生物多样性项目,201210060101号;海洋公益性行业科研专项经费项目,200805069号;国家环境保护部项目,物种10-二-14号;国家科技基础性工作专项项目,2014FY110500号.
中文摘要:

对我国沿海地区10个菲律宾蛤仔野生群体线粒体16SrRNA和COI基因部分序列进行测序,分别得到了长度为473bp和632bp的片段。结果表明,16SrRNA193条序列A+T平均含量为66.6%,共检测到21个变异位点,193个个体具有22种单倍型;COI基因183条序列A+T平均含量为64.8%,共检测到126个变异位点,183个个体具有67种单倍型。基于群体间遗传距离利用Mega5.1软件构建10个群体的NJ树,聚类结果表明,大连群体和荣成群体聚为一支,其余8个群体聚为一支。AMOVA分析表明,大连群体和荣成群体间分化不显著,而荣成、大连群体与其余8个群体问的分化达到极显著水平(p〈0.01),说明我国沿海的菲律宾蛤仔野生群体存在一定的遗传分化。

英文摘要:

Partial sequences of the mitochondrial 16S rRNA gene and COI gene of 10 Ruditapes philippinarum populations in China were sequenced, from which 473bp from 16S rRNA gene and 632bp from COl gene were obtained. The average contents of A+T (16S rRNA gene 66.6% and COl gene 64.8%) were significantly higher than those of G+C. In 16S rRNA gene fragment, 21 variation sites were detected and 22 haplotypes were defined. In COI gene fragment, 126 variation sites were detected and 67 haplotypes were defined. Based on the genetic distance among populations, the NJ phylogenetic trees were obtained. The trees display that Dalian and Rongcheng Populations are clustered in one clade, the rest 8 populations to another. AMOVA analysis showed that genetic differentiation between Dalian and Rongcheng Populations was not significant, while it is extremely significant among Dalian-Rongcheng Populations and the rest of eight populations(P〈0.01), indicating certain genetic differentiation among different wild populations of R. philippinarum in China.

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期刊信息
  • 《海洋与湖沼》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国海洋湖沼学会
  • 主编:孙松
  • 地址:青岛市南海路7号中科院海洋所内
  • 邮编:266071
  • 邮箱:
  • 电话:0532-82898753
  • 国际标准刊号:ISSN:0029-814X
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1149/P
  • 邮发代号:2-421
  • 获奖情况:
  • 2000年中国科学院优秀期刊一等奖,2000年山东省科委、新闻出版黑署评估优秀级,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21021